通过整合转录组和代谢组数据,发现植物可以通过抗氧化酶系统抵消轻度PS-NP诱导的氧化应激,而不启动次级代谢防御机制。而重度PS-NP处理促进了代谢模式从初级代谢到次级代谢防御机制的转变,这种效应在类黄酮生物合成的上调期间特别明显。本研究进一步阐明了关键生化途径在植物对纳米塑料毒性反应中的作用。 图4. PS-NP胁迫诱...
转录组和代谢组的综合分析表明,许多DEG和DAMs参与了相同的苯丙烷类和类黄酮生物合成途径,表明菱角表现出强烈的苯丙类和类黄酮代谢活性。这些初步结果证明了FR和LF之间代谢产物和基因的相关性,为未来控制菱角次生代谢产物合成的具体机制的研究奠定了基础。 文章推荐 文章通过对转录组和代谢组的综合分析,初步结果证明了FR...
通过转录组和非靶向代谢组学技术,我们深入分析了菌根杨树和非菌根杨树幼苗叶片的基因和代谢变化,以揭示AM共生在植物抗虫性上的调控机制。🔍 转录组分析显示,接种AM的杨树幼苗在面对舞毒蛾幼虫的侵袭时,表现出更强的抵抗力。差异基因主要参与茉莉酸生物合成(如脂氧化酶、过氧化氢脱水酶和烯丙基氧化物环化酶)和信号...
类胡萝卜素的积累是类胡萝卜素生物合成和代谢过程的共同结果,这两个过程受到多个基因的表达水平调节。在本研究中,通过代谢组学分析,在3个不同生长时期金线莲叶片中共鉴定到41种类胡萝卜素化合物,经过筛选发现了23种差异代谢物,其中S10生长时期积累的种类及含量最多,而在S3时期时最少。这与在不同生长时期的茶花中结...
联合分析: 通过代谢组学和转录组学的综合分析,揭示红豆杉果实不同颜色形成的机制,构建其调控网络。 图1 技术路线图 研究结果 炎症和表观遗传学之间的关系主要体现在以下几个方面[1] 本文分析了不同发育阶段红(RTM)、黄(YTM)和紫(PTM)红豆杉果实的基因表达和代谢产物。共鉴定出266种黄酮类化合物和35种胡萝卜素...
在转录组和代谢组联合分析中,转录组中的差异表达基因与代谢组检测到的差异代谢物进行关联分析,可以从原因和结果两个层次分析植物体内在变化,锁定与代谢物变化的重点通路,进而构建核心调控网络,从而揭示其内在规律。转录组与代谢组的关联分析方法主要包含以下内容:基于KEGG通路的注释和富集分析、基于皮尔逊的相关性分析和...
该论文综合运用基因组、代谢组、转录组与合成生物学等研究手段,系统分析了枇杷中主要三萜酸小分子在苹果亚科全基因组复制前后的合成通路、表达模式以及进化路线。研究表明,苹果族植物大约在13至27百万年前发生了一次全基因组复制(WGD)事件。与相近物种相比,枇杷基因组在WGD之后保留下了2套完整的乌苏烷型三萜酸合成通路...
代谢组学多组学联合分析逆境胁迫生长发育随着测序技术及质谱技术的发展,获得高通量的测序数据和质谱数据的方法越来越方便,系统生物学通过整合生物系统中诸多相互联系和作用的组分以研究复杂生物过程的机制.组学是基于高通量分析的系统生物学研究,依据研究对象可以分为基因组学,转录组学,蛋白质组学和代谢组学等,不同组学...
转录组和代谢组的综合分析表明,许多DEG和DAMs参与了相同的苯丙烷类和类黄酮生物合成途径,表明菱角表现出强烈的苯丙类和类黄酮代谢活性。这些初步结果证明了FR和LF之间代谢产物和基因的相关性,为未来控制菱角次生代谢产物合成的具体机制的研究奠定了基础。 文章推荐 ...
近日,《生物技术通报》在线发表了题为《 转录组与代谢组联合分析揭示大豆GmERD15c参与盐胁迫下类黄酮的生物合成》的文章。本研究在获得转GmERD15c基因大豆株系基础上,对盐胁迫下大豆的根部进行转录组和代谢组学分析,结果表明大豆GmERD15c基因可能参与类黄酮合成通路,为后续揭示GmERD15c基因的耐盐机制提供了新线索。