通过整合转录组和代谢组数据,发现植物可以通过抗氧化酶系统抵消轻度PS-NP诱导的氧化应激,而不启动次级代谢防御机制。而重度PS-NP处理促进了代谢模式从初级代谢到次级代谢防御机制的转变,这种效应在类黄酮生物合成的上调期间特别明显。本研究进一步阐明了关键生化途径在植物对纳米塑料毒性反应中的作用。 图4. PS-NP胁迫诱...
在转录组和代谢组联合分析中,转录组中的差异表达基因与代谢组检测到的差异代谢物进行关联分析,可以从原因和结果两个层次分析植物体内在变化,锁定与代谢物变化的重点通路,进而构建核心调控网络,从而揭示其内在规律。转录组与代谢组的关联分析方法主要包含以下内容:基于KEGG通路的注释和富集分析、基于皮尔逊的相关性分析和...
代谢物差异分析结果表明,菱角壳中苯丙烷和类黄酮化合物具有较高的代谢活性,印证了转录组分析结果,这些发现为未来使用和开发菱角壳提供了理论依据。 转录组和代谢组的综合分析表明,许多DEG和DAMs参与了相同的苯丙烷类和类黄酮生物合成途径,表明菱角表现出强烈的苯丙类和类黄酮代谢活性。这些初步结果证明了FR和LF之间代谢...
转录组学代谢组学多组学联合分析逆境胁迫生长发育随着测序技术及质谱技术的发展,获得高通量的测序数据和质谱数据的方法越来越方便,系统生物学通过整合生物系统中诸多相互联系和作用的组分以研究复杂生物过程的机制.组学是基于高通量分析的系统生物学研究,依据研究对象可以分为基因组学,转录组学,蛋白质组学和代谢组学等,...
ERD15作为逆境早期响应因子,通过影响植物气孔闭合、ABA信号传导、激素串扰等方面提高植物应对逆境的能力。在之前研究中发现,大豆GmERD15c的异源表达能够增加酵母和拟南芥的耐盐性。本研究主要利用转录组与代谢组联合分析,初步明确了GmERD15c转录因子可能通过参与类黄酮生物合成途径进而提高大豆根系的耐盐性。
为什么要关注“转录组+代谢组”的联合分析呢?这两个层面就像一个因果关系链,可以同时揭示植物生长发育、应对逆境的反应机制,以及植物次生代谢物的合成等重要研究领域。而且,这种分析方式在筛选关键基因、代谢物和代谢通路方面发挥着不可或缺的作用呢~ 为此,我想和大家分享几篇基迪奥生物公司最新的相关植物项目文章,总有...
最后,木瓜的研究展示了通过转录组与代谢组的结合,如何建立起与果实发育相关的生物活性化合物调控网络。这为我们的饮食健康提供了新的见解。 哇,这些案例都让人惊叹不已!通过转录组和代谢组的联合分析,我们不仅能够深入了解植物的生长奥秘,还能为农业的可持续发展提供强有力的支持。希望这些信息能激发你对植物科学的兴...
运用生物技术:转录组学、靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持) 研究背景 冷冻耐受(FT)是北温带植物的一项获得性能力。多年生的木本植物在秋冬两季较短的光周期和较低的温度下逐渐获得FT的过程称为“低温驯化”(CA),而植物在高温下逐渐失去获得的FT的过程称为“去低温驯化”(DA)。近年来,由于暖冬和非季节性气温...
多组学联合分析可以系统地解析复杂的生物学调控机制,特别是“转录组+代谢组”联合分析,可以同时从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题,筛选出关键基因、代谢物和代谢通路,在植物生长发育、逆境胁迫下的响应机制、植物次生代谢物等研究领域有广泛应用。
多组学联合分析可以系统地解析复杂的生物学调控机制,特别是“转录组+代谢组”联合分析,可以同时从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题,筛选出关键基因、代谢物和代谢通路,在植物生长发育、逆境胁迫下的响应机制、植物次生代谢物等研究领域有广泛应用。