它通过多种蛋白质组学和分子生物学方法，包括交联、细胞裂解（蛋白质-DNA提取）、核酸剪切、抗体免疫沉淀、DNA样本回收，将蛋白-DNA复合物分离出来进一步研究特定的结合蛋白或与其结合的DNA，同时结合qPCR（ChIP-qPCR）可用于检测已知蛋白与特定结合位点的DNA是否结合以及结合的强度，结合二代测序（ChIP-seq）可用于分析...
针对这个问题，一方面通过 buffer 条件优化，提供高灵敏 ChIP 试剂盒，最少可用 1000 个细胞进行 ChIP 实验。另一方面，也提供低细胞量的 ChIP-Seq 服务，对于高丰度目标蛋白（如组蛋白修饰）仅需 10000 个细胞；对于低丰度目标蛋白（如转录因子），仅需 50000～500000 个细胞。如何对 ChIP-seq 进行精确定量？我们...
染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)是目前研究蛋白质与DNA相互作用的有力工具和标准方法,主要应用于转录因子结合位点、组蛋白修饰、基因组甲基化以及核小体定位等研究。ChIP与下一代高通量测序技术相结合的ChIP-seq技术具有成本低、效率高、检测的灵敏度和覆盖度高等优势,已经成为这一领域的首选...
· 此外，ChIP-seq等高通量技术的应用可以在全基因组范围内揭示蛋白质-DNA相互作用，为理解复杂的基因调控网络提供了强大的工具。结论 染色质免疫沉淀（ChIP）实验是研究蛋白质与DNA相互作用的重要技术。通过精确的实验设计、严格的样品处理和详细的数据分析，ChIP实验不仅可以揭示转录因子的DNA结合位点，还能深入理解基因...
染色质免疫沉淀技术(ChIP)是在全基因组水平研究生命体组织或细胞内蛋白质与DNA相互作用的一种技术方法。CHIP又分为CHIP-qPCR(已知蛋白和靶序列)和CHIP-seq(已知蛋白和未知序列)。CHIP应用于检测与蛋白结合的DNA序列,常用于研究转录因子或组蛋白修饰。并且CHIP与其他方法的结合,扩大了其应用范围:CHIP与基因芯片相结合...
ChIP-seq (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的高通量测序技术。它通常用于研究转录因子、组蛋白修饰、染色质结构等与基因表达调控相关的生物学问题。, 视频播放量 4441、弹幕量 0、点赞数 269、投硬币枚数 136、收藏人数 1043、
在测序所需样本数量方面,ChIP-chip需要多达 4~5ug的起始样本,通常在杂交之前需要进行连接介导聚合酶链反应(Ligation-mediated polymerase chain reaction,LM-PCR)),可能导致背景增高或竞争性扩增导致假阳性。而ChIP-seq仅需要 ng级起始材料,可以只需要很少的扩增循环或完全不需要扩增,并且随着单分子测序平台以及第三代...
此前,我们分享了染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)的数据挖掘思路,进而筛选出TF结合/组蛋白修饰的目标区域和候选靶基因。 做完ChIP-seq测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。ChIP-seq的进一步验证或后期试验包括以下5个方面: ...
但有一点需要注意,有些靶蛋白的ChIP实验是不适合采用GAPDH的基因来作为靶蛋白抗体的阳性引物对照的,因为异染色质区域的组蛋白修饰类型(例如H3K9me3或H3K27me3等修饰)不会发生在GAPDH基因上,GAPDH是管家基因,一直高表达,一般不会发生H3K9me3或H3K27me3等抑制基因表达的修饰类型。