关于序列比对下列说法正确的是:A.()序列比对可以是2条序列比对,也可以是多条序列比对()B.()DNA序列可以与蛋白序列进行比对()C.()水稻和玉米的淀粉合成酶基因序列的同源性达到85%以上()D.()水稻和玉米的淀粉合成酶基因序列的相似性达到85%以上相关知识点: ...
C语言代码如下 #include<stdio.h>#include<string.h>intscore_array[5][5]={{5,-4,-4,-4,-2},{-4,5,-4,-4,-2},{-4,-4,5,-4,-2},{-4,-4,-4,5,-2},{-2,-2,-2,-2,-1}};intmain(){intclu_score(charseq1[100],charseq2[100],charnormol[5]);charnormol[]="ATCGN";c...
B、对于氨基酸替换计分矩阵来说,等价矩阵效果较差, 疏水矩阵物理意义明确,有一定的理化性质依据,适用于偏重蛋白质功能方面的序列比对,B正确; C、采用多序列比对寻找非同源基因中的序列相似区域较其他方法更合适,C错误; D、BLAST 能被用于寻找对一个蛋白质的功能或结构起关键作用的片段,D正确。 故选BD。反馈...
根据向导树顺序或者队列出队顺序,逐步比对,比对规则为:如果序列 1 和 序列 2 均不在已经添加的序列当中,默认序列 1 与 A 序列进行比对,并调整, 序列 1 或 序列 2 在已经添加的序列之中,以在添加序列的序列为基准,进行调 整。 调整指的是已在最终多序列比对序列中的基准 A1 序列和待规划序列中的 A2 序列...
C语言代码如下: #include<stdio.h>#include<string.h>charseq1_out[100]="\0",seq2_out[100]="\0";//定义比对后的输出一维数组intscores[50][50]={0};//定义得分矩阵intscore_array[5][5]={{5,-4,-4,-4,-2},{-4,5,-4,-4,-2},{-4,-4,5,-4,-2},{-4,-4,-4,5,-2},{-...
第三章序列比对 为什么要序列比对?•基于同源物鉴定的功能预测 •基本假设:序列的保守性 功能的保守性 •因为:1.蛋白质一般在三级结构的层面上执行功能;2.蛋白质序列的保守性决定于其编码DNA的保守性。序列比对中的进化假设 1.所有的生物都起源于同一个祖先;2.序列不是随机产生,而是在进化上,不断发生...
试题来源: 解析 答案:序列比对(Sequence Alignment)是通过在序列中搜索一系列单个性状或性状模式来比较2个(双序列比对)或更多(多重序列比对)序列的方法。 序列比对的分类:A、 双序列比对:两条序列的比对。B、 多序列比对:三条或以上序列的比对。反馈 收藏 ...
下列有关序列比对说法不正确的是 。A.通过序列比对可发现不同序列之间的相似性B.通常分为两两比对和多序列比对C.序列比对用于分析序列之间在单个核苷酸或氨基酸水平上的相似性
1. 打开ClustalW软件,点击“Open sequence file”按钮,选择需要比对的氨基酸序列文件。 2. 在“Output format”选项中选择“Clustal”格式,点击“Output file”按钮选择输出比对结果的文件路径。 4.比对完成后,打开输出文件,可以查看氨基酸序列的比对结果。其中,相同氨基酸会用“*”标记,相似氨基酸会用“:”标记,不同...
转录组(5):序列比对 参考http://www.jianshu.com/p/681e02e7f9af http://www.jianshu.com/p/93f96e7538da 任务: 比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们是带大家入门,请统一用hisat2,并且搞懂它的用法。 直接去hisat2的主页下载index文件即可,然后把fastq格式的reads比对上去得到sam文件。