1.ESPript ESPript是一款免费的用于对位序列展示的在线工具,除了可以显示序列的保守区域,还可以添加蛋白的二级结构,除了支持高dpi的PNG和TIFF格式图片下载,还支持下载PDF格式的矢量图,重点是配色和样式非常漂亮! 配色方案选择Normal时绘图效果如下,你也可以尝试Flashy、thermal、B&W等其他配色方案。 工具链接: https://e...
https://github.com/jokergoo/spiralize 微生信云平台(http://www.bioinformatics.com.cn)以在线作图、在线数据分析为基本方式,致力于0代码分析科研数据,0代码展示数据结果,帮助生命科学、医学等领域的科研工作者更便捷地分析数据,了解数据,挖掘数据背后的生物医学意义,辅助科研,促进知识传播。 平台以110多款在线作图/...
点击send to,选择Complete Record,选择File,下载项选择FASTA,最后点击Create File将序列文件下载到电脑本地。 接着可以使用NCBI数据库中的BLAST在线工具(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)得到同源序列并下载完整的FASTA序列。 在上一个页面直接点击右边工具栏中的--Run BLAST,直接跳转到BLAST工具页面。 点...
序列标识图 (Sequence logo)就是序列的残基Logo,它是以图形的方式依次绘出序列比对中各个位置上出现的残基,每个位置上残基的累积可以反应出该位置上残基的一致性。每个残基对应图形字符的大小与残基在该位置上出现的频率成正比。但图形字符的大小并不等于频率百分比,而是经过简单统计计算后转化的结果。 实操 调整颜色 -...
2.5万 3 02:21 App ClustalW+SnapGene多序列比对作图 20.6万 51 06:03 App 基因进化树的构建和美化(中) 【多序列比对与MEGA构建进化树】 644 0 02:05 App 无需下载软件!Clustalw+espript在线工具联用快速完成序列比对! 2.8万 2 03:49 App 【录屏自用】MEGA7.0的基础使用-序列对比、遗传距离及简单建...
微生信云平台 注册用户38000 引用400 微生信云平台(http://www.bioinformatics.com.cn)以在线作图、在线数据分析为基本方式,致力于0代码分析科研数据,0代码展示数据结果,帮助生命科学、医学等领域的科研工作者更便捷地分析数据,了解数据,挖掘数据背后的生物医学意义,辅助科研,促进知识传播。
微生信云平台(微生信-您身边的数据分析、可视化专家) 注册用户33000,引用350 以在线作图、在线数据分析为基本方式,致力于0代码分析科研数据,0代码展示数据结果,帮助生命科学、医学等领域的科研工作者更便捷地分析数据,了解数据,挖掘数据背后的生物医学意义,辅助科研,促进知识传播。
相信很多小伙伴在看miRNA相关的paper中都看到过如下图所示的miRNA成熟体序列和靶基因的序列比对结果。 那么这样的比对结果是怎么来的呢?我们知道很多miRNA-target之间的结合都是根据序列互补配对预测出来的,因此每一个结合位点都应该能得到一个类似于上图的比对结果。
https://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/ EMBI 的在线双序列比对工具提供了三种选项，1）全局比对；2）局部比对；3）全基因组比对。并且每一个比对工具下提供了不同算法的选择。这里我使用的uniprot 中的ABCB1 的两种亚型的数据。https://www.uniprot.org/uniprot/P08183#sequences 选择Needleman-Wunsch ...
免费在线预览全文 多序列比对结果美化作图 生物信息培训系列之多序列比对结果美化作图--生物技术研究中心晁江涛目录一、常用着色工具二、作图效果展示三、Texshade 工具 四、输入数据格式五、常用参数设置一、常用着色工具SeqLogo/WebLogo,自动分配颜色GeneDoc,手动分配颜色Boxshade,仅黑白模式Esprint,Texshade,黑白模式/彩色...