宏基因组学(或元基因组学,metagenomics)是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序分析,或克隆DNA...
宏基因组学,宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究
宏基因组学研究的基本思路是直接提取环境中所有微生物的基因组DNA,克隆到合适的载体,通过构建宏基因组文库,将环境中全部微生物的核酸信息收集在一起,运用序列筛选或功能筛选方式从文库中获得有用的酶、抗生素等生物活性物质及相关基因。其前端关键性技术是环境DNA(eDNA)的提取,eDNA的提取方法精确程度将直接决定文库...
1.宏基因组学的基本概念 宏基因组学(Metagenomics)是研究自然环境中微生物群落基因组的学科,它通过高通量测序技术直接分析环境样本中的所有微生物基因信息,而无需依赖传统的培养技术。这些样本可以来自多种环境,如土壤、水体、人体或动植物的体表。通过这种方法,研究者能够获得环境中微生物群落的全面基因信息,包括...
而所谓宏基因组学 ( metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、 种群结构、 进化关系、 功能活性、 相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组 DNA, 克隆DNA到合适的载体,导入...
先进的深度学习模型,如卷积神经网络、循环神经网络、图神经网络、自动编码机、注意力机制等在微生物宏基因组学分析中的应用,如提取宏基因组特征、病毒及噬菌体基因组分类和识别、基因组组装、预测疾病相关性、微生物功能预测等。 第一天 微生物宏基因组学测序技术、数据库、经典生物信息分析流程 ...
宏基因组简介 宏基因组学(Metagenomics),又称为微生物环境基因组学或元基因组学,是一种研究特定环境中全部微生物遗传组成及其群落功能的新兴学科。随着高通量、低成本的下一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS),特别是宏基因组下一代测序(mNGS)技术的出现,极大地推动了宏基因组学的研究和应用。宏...
宏基因组学(metagenomics)是对自然环境中所有微生物群体的基因组进行大规模研究的学科。与传统基因组学研究个体生物的基因组不同,宏基因组学通过直接从环境样品中提取DNA,而无需进行单个细菌或真核生物的纯化和分离。这使得研究者可以全面了解整个生态系统中的微生物多样性和功能。 3. 宏基因组学的意义 宏基因组学...
宏基因组学主要通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略来解析环境样品中微生物的遗传组成及其群落功能。这种技术能够捕捉到微生物群落的遗传多样性,包括那些难以或不可培养的微生物,从而揭示它们在生态系统中的角色和相互作用。