宏基因组学（Metagenomics），又称为微生物环境基因组学或元基因组学，是一种研究特定环境中全部微生物遗传组成及其群落功能的新兴学科。随着高通量、低成本的下一代测序技术（Next-Generation Sequencing, NGS），特别是宏基因组下一代测序（mNGS）技术的出现，极大地推动了宏基因组学的研究和应用。宏基因组测序利用...
宏基因组测序,是对特定环境样品中的微生物群落基因组进行高通量测序,以分析微生物群体基因组成及功能,解读微生物群体的多 样性与丰度,探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系,发掘和研究新的、具有特定功能的基因。基于高通量测序的宏基因组学研究 具有以下优势:...
随着生物技术的迅猛发展,下一代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS)已成为现代生物学和医学研究的核心工具之一。NGS技术不仅极大地提高了DNA测序的速度和通量,还显著降低了测序成本。这些优势使得NGS在多个领域得到了广泛应用,其中宏基因组学(Metagenomics)是一个重要的应用方向。本文简要介绍了NGS技术在宏基因组学...
宏基因组学(Metagenomics),又称为微生物环境基因组学或元基因组学,是一种研究特定环境中全部微生物遗传组成及其群落功能的新兴学科。随着高通量、低成本的下一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS),特别是宏基因组下一代测序(mNGS)技术的出现,极大地推动了宏基因组学的研究和应用。 宏基因组测序利用新一代...
宏基因组测序技术(mNGS)因其覆盖度广、特异性好等特点越来越多地被应用于临床感染性疾病的精准诊断,但因一直没有相应的标准而无法在临床进行更为规范化的开展。2020年11月15日,复旦大学附属华山医院张文宏教授作为通讯作者、艾静文博士作为执笔秘书在《中华传染病杂志》发表了“中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病...
王辰院士指出,病原体宏基因组学技术已进入了2.0时代,即通过病原宏基因组学与宏转录组学,联合应用随机测序与靶向测序技术,从病原体鉴定,走向耐药和宿主感染等特征诊断,从病原、药物、宿主三个维度推动精准感染病学的发展。 mNGS带来的变化 此次论坛上,多位专家不约而同地提到明确新冠病毒为疫情病原体惊心动魄的过程...
当rRNA测序和直接从环境中获得的相应基因开始用于微生物多样性的表征时,微生物生态学进入了一个新的阶段。 3.4 宏基因组的发展过程—不可培养微生物的认知 这些研究使人们认识到,通常只有不到1%的天然微生物可以在实验室条件下培养,未培养的物种不仅是微生物群落的主要组成部分,而且可以在生态过程中发挥关键作用。
宏基因组学测序技术(mNGS)是一种无需培养,无需预设就可以深入快速鉴定感染病原体的新技术,这比培养等传统方法学拥有更高敏感性的同时又与精准诊疗的理念相契合。对于辅助临床精准抗感染,进一步提升患者预后和生命体验,具有重要的意义。本文从...
由于单细胞基因组测序技术和宏基因组学测序技术都获得了广泛的关注与认可,所以我们希望广大的科研人员能够使用定义非常明确的术语来描述基因组的完整性,以便于大家对这两种技术的优缺点进行更客观、更准确的评价。比如只有在经过仔细的检验之后,确认获得了一个完整的、连续的、没有错误或缺口的序列时,我们才可以称这条...
相比于高通量测序技术,宏基因组测序技术可以更为全面挖掘出微生物基因组信息,便于研究者挖掘菌群的生物多样性、群落结构、功能特性和相互关系。因此,贵州茅台股份有限公司的王国铮、陈笔、罗寒*等基于宏基因组学技术对3 个轮次(下沙、造沙、1 轮次)高温大曲群落进行精细解析,挖掘其群落结构与功能,并对不同轮次大曲...