比如说在常规的肠道微生物研究中,选取了人体宿主在某个状态下的粪便样本,我们可以利用宏基因组学来获取这些粪便样本中所有微生物的信息;对应地,如果是利用基因组学,则需要先从粪便样本中根据自己的实验条件,分离出某种微生物,再具体对这个微生物(单一菌株培养到指数期的状态)的基因组进行分析研究。可以看到,基因组的...
宏基因组学分析。研究共收集411只红火蚁样品,共发现了17种病毒,包括15种新病毒和2种已知病毒,分属5个科。其中14种具有完整基因组的病毒,3种具有部分基因组的病毒。这些发现为红火蚁的病毒学研究提供了新的信息,并为潜在的生物防治提供了更多选择。 关键词:红火蚁,宏转录组,新病毒鉴定,虫害防治...
📚宏基因组学分析的主要步骤包括: 1️⃣ 样品收集与处理:从环境样品中收集,并进行过滤、离心、提取DNA等处理。 2️⃣ DNA测序:使用高通量测序技术获得大量DNA序列数据。 3️⃣ 序列分析与注释:对测序数据进行质量控制、去除污染序列、拼接和组装,然后进行功能注释和分类。 4️⃣ 生物信息学分析:进行...
研究方法宏基因组学的研究过程一般包括以下步骤:1. 样品的收集与处理:从特定环境收集样品,并进行适当的处理以便于DNA的提取。2. DNA的提取:从环境样品中提取总基因组DNA,这一步是宏基因组文库构建的关键。3. 宏基因组文库的构建:将提取的DNA克隆到合适的载体中,导入宿主菌体。4. 目的基因的筛选:通过功能筛选或...
宏基因组学发展历程1.宏基因组学起源于环境基因组学,其发展推动了微生物生态学的进步。2.随着测序技术的发展,宏基因组学的研究深度和广度不断提升。3.宏基因组学已经成为研究微生物群落的重要工具,广泛应用于多个领域。 宏基因组学简介宏基因组学分析方法1.宏基因组学数据分析包括序列预处理、组装、注释和功能...
宏基因组指为某特定环境中所有微生物的基因组的总和,宏基因组学研究则通过直接分析环境中微生物的DNA来获知微生物群落的遗传、功能与生态特性。 目前的宏基因组研究紧密依赖高通量测序技术,包括扩增子测序与宏基因组测序。 扩增子测序主要针对核糖体RNA基因(rDNA)和功能基因,前者对细菌或古菌16S rDNA 及真菌18S rDNA...
宏基因组学分析简介 宏基因组分析使用宏基因组测序技术来产生数据并完成后续一系列数据处理和挖掘。相比于基于16S基因测序的研究方法,宏基因组研究方法可以全面的分析微生物的物种、基因组成。 下图是宏基因组分析的一般流程: 相关名词解释 基因集(Gene Catalog):由所有样本中检测到的基因构成的集合。非冗余基因集(Non...
随着高通量测序技术的快速发展和应用,二代测序技术如Illumina公司的MiSeq和HiSeq平台已经成为宏基因组学研究中最常用的方法之一、本文将介绍基于二代测序技术的宏基因组学分析的工作流程和一些常用的分析方法。 首先,宏基因组学研究的核心是从环境样品中提取DNA,并进行PCR扩增来构建测序文库。在这一步骤中,研究者需要...
更多医学科研干货,欢迎持续关注~, 视频播放量 1369、弹幕量 0、点赞数 15、投硬币枚数 0、收藏人数 6、转发人数 1, 视频作者 解螺旋官方频道, 作者简介 医生科研成长平台,私信后台发送“训练营”,老谈酸菜免费带你入门医学科研!,相关视频:研究生不同阶级的组会表现,
二代测序技术的出现革新了宏基因组学分析领域,使得研究人员能够高通量地、快速地对环境样品中的微生物群落进行分析。本文将介绍基于二代测序技术的宏基因组学分析流程和主要应用。 一、基于二代测序技术的宏基因组学分析流程 1.样品收集和DNA提取 宏基因组学研究的前提是从环境中采集样品,并提取其中的DNA。样品可以...