并且由于程序的性质，它最多可以占用 30GB 的空间。此步骤只需运行一次，即可用于任何后续的RNAseq比对分...
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为什么RNA-Seq并不能代替WES完成外显子的变异检测?为什么二代测序的原始数据中会有duplicates,而且还有四类,它们分别是什么? RNA-Seq能替代WES完成外显子的变异检测吗? |《达尔文星球》精华第2期48 赞同 · 2 评论 文章 发布于 2018-05-27 11:32
这些技术能够在单管中制备数百个用于测序的 RNA 样品,就 DRUG-seq 而言,无需进行 RNA 分离。由于通常需要大量试剂和人工操作,传统的 RNA 测序样本制备既昂贵又耗时。Alithea的BRB-seq技术大大降低了与RNA测序制备相关的成本和时间。 自最初的种子融资以来,Alithea Genomics 公司在扩大产品组合方面取得了重大进展,...
Kallisto,RNAseq 数据的基本分析和目的,就是获得基因表达量矩阵。在普通笔记本上,如 4G 内存云云,那么 Kallisto 是最好的选择,于是有插件,详细见: Kallisto | 点点点,从 测序数据 到 基因表达量矩阵 人人都可以!- 众筹插件 Trans Value Sum,Kallisto 分析结果是转录本水平的表达量或Counts矩阵,但很多人感兴趣的...
6.Trimmomatic,无论转换得到,或者是公司测序后返还的Fastq.gz 数据往往是原始数据,通过 FastQC 可以判断,随后进行质量控制,如去除接头和低质量碱基,于是有插件,详细见:Trimmomatic | 点点点,测序原始数据质控,技能get- 众筹插件 7.Kallisto,RNAseq 数据的基本分析和目的,就是获得基因表达量矩阵。在普通笔记本上,如 ...