### Install required R-libraries source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("DESeq2") ; library(DESeq2) biocLite("ggplot2") ; library(ggplot2) biocLite("clusterProfiler") ; library(clusterProfiler) biocLite("biomaRt") ; library(biomaRt) biocLite("ReactomePA") ; library(ReactomePA...
Trimmomatic,无论转换得到,或者是公司测序后返还的 Fastq.gz 数据往往是原始数据,通过 FastQC 可以判断,随后进行质量控制,如去除接头和低质量碱基,于是有插件,详细见:Trimmomatic | 点点点,测序原始数据质控,技能get- 众筹插件 Kallisto,RNAseq 数据的基本分析和目的,就是获得基因表达量矩阵。在普通笔记本上,如 4G 内...
| 单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq),也称为单细胞 RNA 测序,是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新的颠覆性技术,是研究单个细胞内基因表达的强有力的工具,可以解决在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,让解析单个细胞的行为、机制及其与...
这些技术能够在单管中制备数百个用于测序的 RNA 样品,就 DRUG-seq 而言,无需进行 RNA 分离。由于通常需要大量试剂和人工操作,传统的 RNA 测序样本制备既昂贵又耗时。Alithea的BRB-seq技术大大降低了与RNA测序制备相关的成本和时间。 自最初的种子融资以来,Alithea Genomics 公司在扩大产品组合方面取得了重大进展,...
6.Trimmomatic,无论转换得到,或者是公司测序后返还的Fastq.gz 数据往往是原始数据,通过 FastQC 可以判断,随后进行质量控制,如去除接头和低质量碱基,于是有插件,详细见:Trimmomatic | 点点点,测序原始数据质控,技能get- 众筹插件 7.Kallisto,RNAseq 数据的基本分析和目的,就是获得基因表达量矩阵。在普通笔记本上,如 ...
这些技术能够在单管中制备数百个用于测序的 RNA 样品,就 DRUG-seq 而言,无需进行 RNA 分离。自最初的种子融资以来,Alithea Genomics 公司在扩大产品组合方面取得了重大进展,尤其…