通过对转录周期的操纵，证明了Pol II在增强子-启动子相互作用中的关键作用。值得注意的是，启动子-近端暂停的Pol II本身部分稳定了相互作用。他们提出了一个更新的工作模型，其中转录动力学元素塑造了相互作用的持续时间或频率，并以此促进增强子-启动子的交流。在本研究中，作者首先在K562细胞中定义了一组功能性增强子...
测试K562细胞中5920个候选增强子的功能,发现功能增强子-启动子对的标准化接触数量显著增加。此外,在相同的超级增强子中,与非功能成分相比,功能成分增强子与目标启动子的接触频率显著更高。即使在排除基因组距离、位点特异性调控效应、染色质可及性和其他混杂因素的影响后,功能活跃的增强子-启动子对的增强子-启动子相互作...
启动子和增强子相互作用 什么是启动子和增强子 启动子的定义和功能 •启动子位于基因的上游区域,在转录起始位点附近,一般由一系列特定序列组成。 •启动子是基因转录的起点,它与转录因子的结合使得转录酶能够结合并开始转录过程。 增强子的定义和功能 •增强子位于启动子附近的DNA序列,可以远离转录起始位点。 •增...
近日，瑞士巴塞尔弗里德里希·米歇尔生物医学研究所Luca Giorgetti研究组在Nature上发表了文章Nonlinear control of transcription through enhancer-promoter interactions，通过对特定启动子的分析，将增强子定位在染色体不同位置上，揭开增强子转录效应与启动子相互作用已以及输出的非线性相关关系。染色体构象捕获实验发现增强子与...
想象一下,在一个晚会上,启动子穿着礼服,优雅地走到舞台,准备开始表演。这时,增强子就在后台默默地调整着音响,确保每一个音符都能传到每一个角落。没有增强子的助力,启动子就算再有风度,也难免显得有些冷清。 说到相互作用,这就好比两个好朋友,彼此之间有着微妙的默契。增强子和启动子之间的关系就像是兄弟般的...
近日,瑞士巴塞尔弗里德里希·米歇尔生物医学研究所Luca Giorgetti研究组在Nature上发表了文章Nonlinear control of transcription through enhancer-promoter interactions,通过对特定启动子的分析,将增强子定位在染色体不同位置上,揭开增强子转录效应与启动子相互作用已以及输出的非线性相关关系。 染色体构象捕获实验发现增强子与启动...
CTCF非依赖机制所驱动的增强子-启动子之间的相互作用研究的并不算深入,但已经发现LDB1, YY1和调节因子复合物(the mediator complex)等分子桥梁。另外,增强子-启动子之间的接触也是基因转录的步骤之一,同样是相同转录因子所调控基因簇的组成成分和相似组蛋白修...
总的来说,这项工作发现KMT2B参与了H3K4me1在增强子上的催化作用,并为H3K4me1在胚胎干细胞到神经前体细胞分化中增强子-启动子相互作用和转录中提供了额外的支持。 原文链接: https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(...
而启动子是位于基因上游的一段DNA序列,能够与RNA聚合酶结合并启动转录过程。 三、远程增强子-启动子相互作用的重要性 基因的表达受多种因素的影响,包括转录因子的结合、染色体构象等。远程增强子-启动子相互作用作为一种重要的调控机制,可以跨越较大的基因距离来调控基因的表达。因此,识别和解析这种相互作用对于理解基因...
启动子是另一个重要的顺式作用元件,它控制基因的转录起始。增强子与启动子之间的相互作用对基因的表达具有重要影响。然而,由于它们的相互作用受到多种因素的影响,如细胞类型、环境条件等,因此识别它们之间的相互作用一直是研究的难点。 三、研究方法 本研究采用生物信息学和基因组学的方法,结合实验验证,对人类细胞系中...