实验使用人Ramos(B细胞)和Jurkat(T细胞)进行scChIP-seq后,发现单细胞染色质谱和共识聚类明确了每个细胞系的2个稳定簇,H3K4me3和H3K27me3谱的细胞身份匹配特异性分别超过99.7%和99.5%,聚集的单细胞图谱以高精度重现了bulk ChIP-seq 图谱(图1.b-d)。此外,scChIP-seq差异分析鉴定Ramos和Jurkat细胞特有的激活和抑制...
该研究是基于单细胞ChIP-seq解析乳腺癌耐药性产生的基因调控机制。 图:小鼠基质细胞的单细胞ChIP-seq分析揭示了从H3K27me3染色质景观中获得的细胞特性 爱基百客在bulk ChIP-seq上积累丰富的项目经验,这些对于单细胞ChIP-seq是极大的助力,期待有相关需求的老师和我们沟通交流。此外,单细胞ChIP作为新产品,我们也送出...
其实如果你看过我表观组学系列,比如《ChIP-seq数据分析》和《ATAC-seq数据分析》就会知道这些技术都可以被单细胞化, 如果你具备比较好的背景知识,理论上是可以自己根据文档把它们对应的单细胞水平的数据分析摸索成功。那就作为学徒作业吧,摸索scChIPseq数据分析流程! 文章是:High-throughput single-cell ChIP-seq iden...
该研究是基于单细胞ChIP-seq解析乳腺癌耐药性产生的基因调控机制。 图:小鼠基质细胞的单细胞ChIP-seq分析揭示了从H3K27me3染色质景观中获得的细胞特性 爱基百客在bulk ChIP-seq上积累丰富的项目经验,这些对于单细胞ChIP-seq是极大的助力,期待有相关需求的老师和我们沟通交流。此外,单细胞ChIP作为新产品,我们也送出...
-, 视频播放量 3、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 扌戈课钾arg653, 作者简介 ,相关视频:单细胞双疾病联合bulk转录组测序GSEA富集分析CIBERSORT免疫浸润,单细胞测序研究数据挖掘分析 转录组RNA scRNAseq 二代测序自,美女大学生口腔
两个月从零基础开始, 单细胞测序、chipseq、RNAseq、Atacseq 空间转录组和外显子等。 将生信内容全部学懂(理解)、学会(会敲代码分析)、学透彻(站在顶层设计角度理解)、学以致用(用到自己的标书申请和文章发表中)。 主讲老师华哥:毕业于中山...
之前翻译了一篇单细胞ChIP文章单细胞ChIP-seq技术(CoBATCH) 看到有这个图,大概意思 :将H3K27ac 位点及其细胞分别进行了层次聚类,使用HOMER进行每个enhancer module de nove TF, 使用GREAT进行GO富集分析。使用二项分布进行P-Value。 image.png 以为就是行是很多peak 位置,列是不同细胞的count matrix聚类热图,用pheat...
微生物16S/ITS/18S分析原理讲解医学会员免费学 Ma_jour 3 0 生信必发SCI系列:1对1指导,31个议题,100个教程,零基础也能发5分生信SCI医学会员免费学 Ma_jour 0 0 杨新春大师课快速心律失常机制的诊断和治疗医学会员免费学 Ma_jour 0 0 展开
简而言之,CoBATCH技术是第一个具有普适性、高质量、高通量的单细胞ChIP-seq方法,该技术将在单细胞水平上为解析细胞命运决定和功能异质性的表观遗传调控机制提供强有力的支持,并对研究器官发育和疾病发生过程具有重大的意义。北京大学分子医学研究所博士生王千昊、艾珊珊、刘雅茜和北京大学-清华大学生命科学联合中心博士...
简而言之,CoBATCH技术是第一个具有普适性、高质量、高通量的单细胞ChIP-seq方法,该技术将在单细胞水平上为解析细胞命运决定和功能异质性的表观遗传调控机制提供强有力的支持,并对研究器官发育和疾病发生过程具有重大的意义。北京大学分子医学研究所博士生王千昊、艾珊珊、刘雅茜和北京大学-清华大学生命科学联合中心博士...