上节我们讲到转录组测序相关内容,这期将继续学习单细胞转录组测序。单细胞测序技术(single cell sequencing),简单来说,就是在单个细胞水平上,对基因组、转录组及表观基因组进行测序分析的技术(图1)。 图1.单细胞测序技术 ◆ 为什么做单细胞转录组测序? ◆ 普通转录组(bulk RNA-seq)是生物组织样品中在某个时间...
单细胞转录组测序技术正以迅猛的发展势头被生命科学研究所广泛运用。未来,高通量单细胞转录组研究也会为科学研究带来更多的成果和产出。 荻硕贝肯目前拥有完善的科研服务平台,拥有质谱、二代测序、数字PCR、荧光PCR、流式细胞仪、单细胞测序等平台,可以开展从DNA-->RNA--...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是在单细胞水平上研究基因表达差异的技术,为细胞异质性研究提供了有力手段。而单细胞ATAC测序(scATAC-seq)是利用转座酶在单细胞水平上研究染色质开放性的技术,可以提供高分辨率的单细胞染色质开放图谱,有助于深入研究细胞异质性的表观遗传调控机理。它们的研究对象一个是mRNA,一个是染色...
单细胞转录组测序是在单细胞水平对转录组(mRNA)进行测序的一项新技术,可发现细胞群体中真正起作用的细胞,特别适合对高度异质性的干细胞、肿瘤细胞及胚胎发育早期的细胞群体进行研究,重新认识细胞分子机制和基因调控网络。 技术优势 10年转录组学项目经验,提供单细胞项目全程支持。
单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。 单细胞转录组的发展史 单细胞转录组测序特点 单细胞转录组测序可对单...
单细胞基因组测序目前主要有两种扩增方法:MALBAC方法及MDA方法,而单细胞转录组目前主要有三种方法:SMART扩增技术、10×genomics技术及Andeplete技术。今天主要和大家比较下单细胞转录组测序的三种常用方法。 一、SMART扩增技术: SMART技术的出现是一个新的里程碑。这个称作Switching Mechanism At 5’ end of the RNA ...
如图所示,凝胶珠上的寡核苷酸链依次为Illumina TruSeq Read 1测序引物、16bp 10X Barcode序列(用于区分细胞)、12 bp unique molecular identifier(UMI,区分细胞的不同转录本并去除PCR Duplications,降低扩增偏好性)、30 bp poly dT反转录引物。在随后的文库构建中,相同的细胞扩增出的cDNA带有相同的10x Barcode,其中...
单细胞和bulk转录组平行分析揭示胃肿瘤微环境的关键特征 标题:Parallel single-cell and bulk transcriptome analyses reveal key features of the gastric tumor microenvironment 期刊名称:Genome Biology IF:17.906 发表时间:2022年12月 应用技术:单细胞转录...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是高通量基因表达测序技术,可同时测定单个细胞内数千个基因的表达水平,从而描述每个细胞的转录谱。单细胞免疫组测序(scVDJ-seq)可揭示单个免疫细胞中的V(D)J重排序列以及免疫细胞的抗原受体多样性。如果将这两组数据进行关联分析,可以更全面地了解单个细胞的转录特征和免疫行为,并且有助...