视频是之前刚学单细胞录的第一个视频,整理了个PPT讲得不是很流畅但是讲得很细(每一行代码包括参数做啥用都讲了),适合单细胞初学者观看视频中代码有点乱,现在是强烈推荐用最新整理好的单细胞合集1.1的代码(附视频):BV1QQ4y1t7gf, 视频播放量 23910、弹幕量 32、点赞
单细胞测序数据分析/多样本单细胞SeuratV5标准流程分析全代码/单细胞转录组最新教程/单细胞数据一键分析/单细胞Harmony整合去批次/单细胞实战/入门共计20条视频,包括:单细胞SeuratV5标准流程全代码、单细胞数据下载和读取、单细胞txt&csv&h5格式多样本批量读取整合分析等
单细胞转录组测序技术(single cell RNA-seq)及细胞分离技术分类汇总 (*AIPuFu-免费大型综合生物信息学资源和工具平台*) 单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进… AIPuFu 单细胞转录组分析 02 | Seurat 学习 白墨发表于生...
1. 质量控制（QC）：这是首要步骤，用于剔除低质量数据和重复细胞。通过检查文库大小、基因特征数量和线粒体基因表达等指标，确保数据质量。2. 归一化：由于技术差异和数据稀疏性，需要对数据进行标准化处理，以克服cDNA扩增偏差和液滴空载等问题。专为单细胞RNA测序设计的归一化方法优于传统方法。3. 降...
天津生物芯片作为国内较早引进10X Genomics平台的测序服务商，经验丰富，下面整理10X Genomics测序分析流程 方法/步骤 1 1.数据预处理流程 2 工具介绍 1，SCFastp——采用fastp软件对下机原始数据进行过滤过短、低质量序列及接头处理等操作。2，UMI_tools_whiteList——采用UMI-tools的whiteList功能建立真实细胞条码的白...
2、一种基于ont测序的单细胞转录组的测序分析方法,包括以下步骤: 3、制备、构建待测样品的cdna文库,测序,获得所述待测样品的三代原始数据;对所述三代原始数据进行质控,得到所述待测样品的三代有效数据; 4、对参考基因组的基因和转录本进行功能注释;
下⾯为您介绍 10X 单细胞转录组测序分析流程及原理。 01 10x 单细胞标记原理 在介绍分析流程之前,先简单回顾下 10x 单细胞标记原理以及⽂库结构,便于对后续分析的理解。Gel bead(凝胶磁 珠,下图左)上含有全长 Illumina TruSeq Read 1 测序引物、16nt 10X Barcode 序列、12nt unique molecular identifier (...
1.一种适用于10x单细胞转录组测序数据的分析方法,其特征在于,包括下列步骤: 1)测序数据处理, 使用10xgenomics官方的cellrangercount流程对原始数据进行处理: 使用count程序对下机的fastq文件进行处理,得到每个细胞的基因的表达reads数; 根据count程序生成的网页中的信息,对测序结果进行质控; 2)seurat数据过滤, 使用seura...
1、为了克服现有技术的不足,本技术实施例的目的在于提供一种基于单细胞全转录组测序数据的分析方法、系统、装置,通过lncrna分析和circrna分析,进行单细胞全转录组基因表达定量,最后进行亚群上调表达基因分析,解决现有技术中对单细胞全转录组测序数据,即scfast-seq数据分析不够全面具体和涉及范围不够广泛的问题。