对青春期不同阶段相关细胞组成的鉴定和不同细胞间独特的转录特征的表征，有利于特定神经元的分离和对其功能的进一步了解。因此这篇文章利用10× Genomics Visium平台，对雌性SD大鼠出生后25、35、45天的下丘脑进行空间转录组测序，构建弓状核（ARC）基因表达的动态空间图谱。通过比较不同的下丘脑细胞群，揭示了Kiss1+...
研究人员发现,CD8+T细胞克隆型的组织类型位置在很大程度上定义了其耗竭状态,而肿瘤内的空间异质性并不能很好地解释体细胞异质性。通过单细胞RNA测序数据中的新突变,研究者推断基质细胞的克隆性和谱系追踪髓系细胞的发展。研究还发现了区分肿瘤细胞功能的六个保守元程序,并发现一个上皮-间质转化元程序在肿瘤-正常界面...
比如,单细胞技术就有:单细胞转录组、单细胞免疫组库、单细胞表观组(单细胞ATAC-seq)、单细胞基因组(单细胞DNA测序等)、单细胞蛋白组(表面蛋白Total-seq测序等)。而在空间技术运用方面也有很多不同的方法以及不同的运用,10x Visumn算是大家听到最多的技术了,此外还有Digital Spatial Profiler(DSP)、Geo-seq、 To...
本研究利用单细胞和空间转录组技术,揭示了血小板在肾损伤修复中的不利影响。研究发现,耗竭血小板可以加速损伤的恢复并显著减少纤维化。研究进一步识别了巨噬细胞作为血小板信号调节的主要介质,并发现了一种新型的巨噬细胞亚型--“增殖性 M2 巨噬细胞”,该巨噬细胞受到 THBS1 信号的调节,具有促进纤维化的特性。通过基...
方法：10× Genomics scRNA-seq(欧易生物单细胞转录组测序)、10×Genomics visium(欧易生物空间转录组测序)研究背景和研究目的 溶瘤病毒（Oncolytic virus, OV）是一类具有复制能力的肿瘤杀伤型病毒，能选择性感染肿瘤细胞，在肿瘤细胞内大量复制并最终摧毁肿瘤细胞，同时激发免疫反应，吸引更多的免疫细胞继续杀死残余的...
一、单细胞测序联合空间转录组测序一般流程 二、单细胞测序联合空间转录组整合方法 三、Cell2location介绍 四、小编总结 单细胞RNA测序(scRNA-seq)可以识别组织内的细胞亚群。scRNA-seq技术的出现,使得人们可以对细胞的基因组学、转录组学以及表观基因组学进行精准的研究。但不能捕捉它们的空间分布,也不能揭示细胞间...
方法：高通量单细胞转录组测序联合空间转录组测序 研究背景 肝细胞癌（HCC）是一种高死亡率的原发性肝癌。它是一种全球范围最常见的恶性肿瘤。目前其诊断和治疗已取得了一定进展，但总体临床效果仍然很差。HCC 在基因组、分子和组织学水平上具有高度异质性，肝细胞癌中的MTM亚型和包裹肿瘤簇的血管 （VETC） 模式...
2022年12月13日, 中南大学湘雅三医院放射科冯智超博士(容鹏飞、王维教授团队)在国际顶级学术期刊Radiology(IF:29.146)上在线发表了CT放射组学模型预测肝癌病理分型和免疫状态的文章,本研究利用影像组学、转录组学和单细胞多组学技术,原创性地构建了影像人工智能模型。放射组学数据和单细胞RNA测序的联合分析有助于确定新的...
单细胞转录组测序使单个肿瘤细胞的无偏倚转录组分析成为可能,并揭示同一肿瘤的恶性细胞之间的异质性。结合空间转录组测序和多色免疫荧光分析使TME的特定细胞类型与癌细胞状态之间的因果关系变得更清晰明了。 在今天分享的文章中,来自纽约大学朗根医学中心的Itai Yanai研究团队对15种癌症类型进行了泛癌单细胞RNA测序分析(...
单细胞蛋白质组测序是一种通过测定单个细胞的蛋白质来分析其蛋白质组的方法。该技术可以对细胞的蛋白质表达进行分析,从而揭示不同细胞类型之间的差异和相似性,并且可以研究细胞的发育和病理生理学。 二、空间转录组技术 空间转录组技术是一种通过对组织中的基因表达进行空间定位的方法。与单细胞测序技术不同,空间转录...