install.packages("Matrix",repos="http://R-Forge.R-project.org")输入上述代码后,会自动显示(WAR...
单细胞数据分析/入门必看/标准分析流程/实战为主/保姆级教程/生物信息学/R语言/生信分析/单细胞/转录组/单细胞测序共计22条视频,包括:0. 单细胞转录组简介、1. 常用单细胞R包的安装、2. 单细胞Seurat对象的层级结构,单细胞数据分析等,UP主更多精彩视频,请关注UP账号。
R语言在生物信息学和生物学研究中是一种常用的编程语言,它提供了丰富的工具和库来处理和分析生物数据。其中,一个重要的R包是scater,它是一个专为单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析而设计的包,为研究人员在处理、可视化和理解单细胞数据方面提供了强大的支持。 scRNA-seq技术已经成为了研究单个细胞基因表达的主要手段。
单细胞测序能够更好的抓住这些细节问题。单细胞测序最初要解决的两个重要的问题是单个细胞的捕获(细胞通...
r语言单细胞测序分析如何提取细胞亚型数据 单细胞rna测序分析,◆ 单细胞测序的概念 ◆ 上节我们讲到转录组测序相关内容,这期将继续学习单细胞转录组测序。单细胞测序技术(singlecellsequencing),简单来说,就是在单个细胞水平上,对基
一套零基础入门的 R 语言代码 R 以及 Rstudio 软件 学习R 语言入门到实战不同等级的电子版教材 一套单样本自动化分析的单细胞转录组代码(含自动画图) 一套多样本联合自动分析的单细胞转录组分析代码(含自动画图) 一套多样本批次效应校正及自动分析的代码(含自动画图) ...
单细胞测序的数据分析 R语言 单细胞测序研究思路 一、单细胞及普通转录组比较 单细胞转录组测序(scRNA-seq)在单个细胞水平上构建每个细胞的基因表达谱,反映细胞异质性,发现新的细胞类型,了解细胞表达调控机制。通过选取不同时间点的样本,再进行单细胞转录组测序,能够在单细胞水平获得基因“时间动态表达”的信息。单...
2、单细胞测序应用经典案例: 单细胞测序解析糖尿病肾病中肾小球的动态变化单细胞测序技术解析健康人与T2D患者的胰岛差异小鼠全肾单细胞测序开篇之作 3、R语言基础: 打开R语言的大门 30条R语言基础命令 安装R包的几种方式 4、Linux基础 常用Linux命令 二、不浪费篇幅,视频奉上 ...
1. 常用单细胞R包的安装 05:48 2. 单细胞Seurat对象的层级结构,单细胞数据分析 09:51 3. 单细胞Seurat对象的读入方式,单细胞数据分析 25:21 4. 单细胞的质量控制,单细胞数据分析 14:10 5. 寻找双细胞(DoubletFinder),单细胞数据分析 07:12 6. 去除细胞周期的影响,单细胞数据分析 04:50 7. 标准化,高...
相信经过大家这一个礼拜的学习,已经能够熟练的掌握R语言与Linux,现在我们就正式开始课程!有疑惑欢迎后台交流。 一、代码: 二、视频: 保姆级教程 《手把手教你做单细胞测序...