为进一步探究NBPF1如何调控海马发育,研究者进行ATAC-Seq分析,并对小鼠颗粒细胞进行单细胞定量RT-PCR,结果一致发现NBPF1通过LHX2调节海马发育的分子机制。 图4胚胎发育中海马表达的特异性基因 综上所述,本研究系统地分析了胚胎发育中海马体的scRNA-seq和ATAC-seq数据,详细的阐述了人类海马在发育中的细胞多样性、动态...
每个细胞一万次读数(每个测序运行2000个细胞)是scNanoATAC-seq方法的最大通量。 研究者在细胞类型特异性转录因子的结合位点上发现了强烈的足迹,这与10×scATAC-seq数据中的足迹一致。为了评估scNanoATAC-seq方法是否适用于体内样品,研究者对来自单个供体的分选和未分选的PBMC进行了scNanoATAC-seq。CD4 T细胞,CD8 T细胞...
第十九节课:以cell文章为例 系统讲解单细胞的RNA velocity应用 第二十节课:系统学习linux操作系统 chipseq全流程分析以nature文章为例 包括质控 上数据比对 、MACS2、IGV进行可视化 第二十一节课:chipseq下游的motif富集 不同处理直接的峰值overlap韦恩图 差异paek寻找 peak注释 以cell文章为例超级增强子寻找 第二十二...