unique(CellChatDB$interaction$annotation)#查看可以选择的侧面,也就是上图左中的三种#选择"Secreted Signaling"进行后续细胞互作分析CellChatDB.use<-subsetDB(CellChatDB,search="Secreted Signaling")# use all CellChatDB for cell-cell communication analysis# CellChatDB.use <- CellChatDB # simply use the defa...
在CellChat中，我们还可以先择特定的信息描述细胞间的相互作用，可以理解为从特定的侧面来刻画细胞间相互作用，比用一个大的配体库又精细了许多。对表达数据进行预处理，用于细胞间的通信分析。首先在一个细胞组中识别过表达的配体或受体，然后将基因表达数据投射到蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络上。如果配体...