对这些细胞相互作用事件的破坏和改变可能会产生严重的下游病理生理影响，这对治疗发展尤为重要，细胞-细胞相互作用的深入了解被越来越多地用于开发临床免疫疗法，以调节和利用细胞表面的细胞间通信。研究细胞间相互作用的技术 研究细胞-细胞相互作用的生物成分和过程的多样性具有一系列跨学科的方法，可以分为细胞成像、基于...
细胞-细胞相互作用(CCIs)是多细胞生命的基石,允许细胞在群落中存在并执行集体功能。细胞通过产生不同的分子和膜结构相互作用,激活其他细胞中的信号通路,协调基因表达,然后驱动细胞功能。这些相互作用包括结构蛋白和功能蛋白、小化合物、细胞外基质、膜突起和细胞外囊泡等。其中,与其他细胞上的同源受体结合的配体,或配体...
在相互作用的细胞表面上分别表达蛋白质片段来探索细胞-细胞相互作用。例如跨突触的GFP蛋白片段重组(GRASP)方法中,利用两个非荧光状态的GFP蛋白片段检测CCIs的相互作用时,当细胞发生紧密接触时,两个蛋白质片段重组后由非荧光切换为荧光状态,实现细胞间相互作用成像。该方法已被用于研究小鼠海马神经元中突触间的相互作用。
研究策略:研究人员通过CRC和其肝转移的密切关系确定的研究目的,然后引入EVs介导的细胞-细胞间的相互作用来探讨肝脏微环境对CRC肝转移肿瘤细胞的影响作用和机制。接下来作者特异性的检测了EVs的重要内容物microRNAs在不同条件下的变化谱并锁定了发挥作用的关键microRNAs,并依次进行下游靶点的筛选和功能验证,最终在患有脂肪...
1.细胞-细胞相互作用的接触依赖标记(图5) 接触依赖标记方法通常需要细胞表面的酶与邻近细胞膜表面的底物发生直接接触,随后通过酶催化激活生物素探针标记邻近细胞膜表面的受体底物上。这种标记方式基于酶与受体底物的物理接触,可保证较小范围的标记半径。 图5 基于酶与受体底物的直...
在多细胞个体中,组织形成,神经传递以及免疫响应等细胞间结合的生理过程中涉及细胞-细胞相互作用(CCIs, cell-cell interactions)。CCIs产生或传递的生理信号可通过膜表面蛋白以接触另一细胞表明受体的方式或者通过分泌化学信号的方式进行。在细胞间信号传递时,CCIs发生的过程高度动态、参与的组分也十分复杂。因此,解开CCIs中...
细胞-细胞相互作用以蛋白质、糖类或者脂质作为媒介,形成稳定或者瞬时的细胞连接、黏附,实现细胞信号的传递以及更为复杂的细胞生理学功能,在细胞生命系统中发挥重要作用。例如,在肿瘤微环境中内皮细胞、间质细胞与免疫细胞之间的相互作用共同影响着肿瘤的命运...
以单细胞分辨率进行跨条件的细胞-细胞相互作用(CCI)比较存在挑战:样本细胞数量的差异可能与某些算法不兼容,这意味着可能需要包括数据插补,尤其是在单细胞分辨率下,例如DURIAN、 CellChat (V2)、CellPhoneDB (V5)和LIANA+等算法通过不同策略改善此挑战。 构建LRIs数据库是研究CCIs的关键:这一步骤涉及一些基本方面,如关注...
研究策略:研究人员通过CRC和其肝转移的密切关系确定的研究目的,然后引入EVs介导的细胞-细胞间的相互作用来探讨肝脏微环境对CRC肝转移肿瘤细胞的影响作用和机制。接下来作者特异性的检测了EVs的重要内容物microRNAs在不同条件下的变化谱并锁定了发挥作用的关键microRNAs,并依次进行下游靶点的筛选和功能验证,最终在患有脂肪...
CITEdb首次尝试在细胞类型水平上对细胞-细胞相互作用进行梳理。数据库内的所有细胞互作对均经过严格的人工校验并具有包括生理功能和受体-配体对等详尽的注释信息。该数据库可以作为测试基准评价不同计算工具预测得到的细胞间通讯关系,为单细胞研究提供强有力的基础。 研究背景 细胞是多细胞生物的基本单位。生命体的复杂...