245 -- 5:09 App 13.单基因泛癌临床信息合并代码详解 383 -- 4:51 App 10.多基因泛癌estimate分析代码详解 259 -- 7:14 App 9.单基因泛癌筛选正负相关基因代码详解 448 -- 4:31 App 10.单基因泛癌GSEA分析代码详解 423 -- 3:20 App 22.单基因泛癌estimate相关性分析代码详解 245 -- 2...
447 -- 4:12 App 23.单基因泛癌cox回归分析代码详解 277 -- 6:51 App 15.单基因泛癌cebersort相关性分析代码详解 3301 -- 7:29 App 1.GTEX数据的下载代码详解 425 -- 3:20 App 22.单基因泛癌estimate相关性分析代码详解 384 -- 3:21 App 16.单基因泛癌tmb基因相关性分析代码详解 240 -...
该文件为提取的感兴趣基因泛癌基因表达和生存信息文件,第一列为表达量,第二列和第三列为OS和OS.time,第四列和第五列为DSS和DSS.time,第六列和第七列为DFI和DFI.time,第八列和第九列为PFI和PFI.time。 3.summary_of_cox_result_in_pancancer.txt 该文件为感兴趣单基因泛癌预后cox分析结果文件,基于四种...
Step 3:单基因泛癌免疫浸润分析工具共得到2个结果图,可以在结果展示页面直接点击某个图进入预览页面,也可以直接下载使用。 结果说明 Cibersort分析热图【Cibersort.svg】:该图表示输入基因在各个肿瘤中与22种免疫细胞的相关性。 EPIC分析热图【EPIC.svg】:该图表示输入基因在各个肿瘤中与8种免疫细胞的相关性。 结语 ...
5.GSEA_regarding_HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION_in_pancancer.pdf 该图片为感兴趣基因集单通路的泛癌GSEA富集分析气泡图,用不同颜色表示NES大小,点的大小表示-log10(FDR)大小。 小云最终完成了感兴趣基因集单通路的泛癌GSEA富集分析,需要代码的小伙伴关注公众号,回复“代码”可以免费领取代码相关内容。
该文件为感兴趣单基因泛癌预后cox分析结果文件,基于四种结局类型。第一列表示肿瘤名称,第二列表示结局类型,第三列表示回归系数,第四列表示Hazard ratio,第五列和六列分别表示置信区间下限和上限,第七列为Pvalue值。 4.summary_of_km_result_in_pancancer.txt ...
Step 3:单基因泛癌免疫浸润分析工具共得到2个结果图,可以在结果展示页面直接点击某个图进入预览页面,也可以直接下载使用。 结果说明 Cibersort分析热图【Cibersort.svg】:该图表示输入基因在各个肿瘤中与22种免疫细胞的相关性。 EPIC分析热图【EPIC.svg】:该图表示输入基因在各个肿瘤中与8种免疫细胞的相关性。