利用原位杂交技术和空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq),研究了洋葱鳞茎形成过程中海绵状叶肉细胞扩增相关的细胞类型分类和基因表达变化,从而揭示了鳞茎形成基因的功能作用。 图5. 空间RNA-seq揭示了代谢过程和洋葱鳞茎形成过程中基因表达的空间分布 6. 长雄野生稻根茎形成的时空转录图谱 期刊:Plant Biotechnology Journal ...
Stereo-seq技术将认识生命空间表达的分辨率提高到500nm的亚细胞层级;可以通过图像识别细胞核位置,并结合算法实现单个细胞及分子信息的空间定位和检测;也可以通过binning的方式,识别组织中的不同功能区域。 如果您计划开展Stereo-seq的科研项目,欢迎联系我们~ 关于我们 武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉...
图中展示的,就是一个小鼠胚胎的空间表达图谱。 Stereo-seq时空组数据分析方案中cellbin算法可以实现单细胞水平的分析。 我们前面谈到过,在把切片贴到芯片上之后,第一步就用 Qubit ssDNA(Invitrogen Q10212)染料对切片进行染色,并进行荧光拍照。 然后,在测序完成之后,就可以把测序得到的转录本和拍照得到的荧光照片,拟...
Stereo-seq*是华大自主研发的时空转录技术,该技术基于DNA纳米球(DNA Nano Ball,DNB)开发,具有高通量、超高分辨率、大视场的原位全景式技术、可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空间转录分析。该技术通过时空芯片捕获组织中的mRNA,并...
4月29日，2024中关村论坛年会“重大成果专场发布会”于北京举行，面向全球重磅发布了一批重大原创成果、重磅创新政策、最新研究报告，持续打造全球前沿科技和未来产业的“风向标”。华大时空组学技术Stereo-seq作为“面向人民生命健康”的重大科技成果之一入选并发布。华大时空组学技术Stereo-seq入选重大科技成果。华大集团供...
杭州华大生命科学研究院、深圳华大生命科学研究院联合广东省医学科学院、华南师范大学、武汉大学等多家科研单位,利用华大自主研发的高分辨率时空组学技术Stereo-seq,绘制了首个蝾螈端脑发育及再生的时空单细胞转录组图谱,鉴定了蝾螈端脑再生过程中...
Stereo-seq时空组学技术作为一种基于 DNA 纳米球 (DNB) 模式阵列的全基因组技术与其他空间转录组技术相比,实现了500nm的分辨率,成为全球首个同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的技术,且实现了基因与影像同时分析。到目前为止,Stereo-seq在癌症研究领域已发表多篇文章,今天我们就一起来看一下吧。
全球领先的时空组学到底是什么?华大自主研发的Stereo-seq告诉你。 #尹烨科普 #华大集团总部直播间 - 尹烨于20230312发布在抖音,已经收获了657.6万个喜欢,来抖音,记录美好生活!
关于Stereo-seq 华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,是一项实现超高通量、超高精度的全景式时空转录组技术。Stereo-seq通过时空捕获芯片,结合原位RNA捕获,实现了500 nm的分辨率,标准捕获芯片为1 cm×1 cm,同时可满足大面积芯片定制,成为全球首个同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的技术,且实现了基因与...
当前,基于Stereo-seq技术,时空组学STomics联合#华大智造#已推出四款产品方案,全面覆盖了时空转录组学和多组学,新鲜冷冻(FF)以及福尔马林包埋(FFPE)样本,并创新性地提出了大尺寸芯片解决方案,确保研究的广度与深度。结合自主研发的时空显微镜Go Optical、时空自动化样本处理系统Go Spatial、DNBSEQ测序平台以及专业的建库试...