一般来说,小分子配体的结构越符合蛋白质的结合口袋,其对接的结合能标准就会更高。 2.蛋白质的结合口袋:蛋白质的结合口袋大小、形状、电荷等性质会直接影响小分子配体与蛋白质的对接结合能标准。如果结合口袋与小分子配体的结构不匹配,则对接的结合能标准可能很低。 3.溶剂条件:溶剂的种类和性质也会影响小分子配体...