分辨率越高,结构越准确。例如,优先选择分辨率为0.9Å的蛋白结构,因为这表示分子直径与光波长度的比值,值越小,分辨率越高。 🎯 活性位点:选择那些已知或推测为活性位点的蛋白,这些位点是配体与受体结合的关键区域。这些信息可以通过蛋白数据库如PDB获取。 🌐 生物学功能和疾病相关性:选择与研究目标密切相关的蛋白。
新人求助,做分子对接时,在PDB数据库中搜索蛋白,遇到同一个蛋白具有多个结构的情况,比如NR5A2具有1...
选择与晶体结构最接近的,或者重新以晶体结构为参照进行对接。
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