在实际模拟中，一个系统可能包含几千到几十万个原子，同时可能需要模拟几十万步或者更多，所以我们需要用专门的可进行并行计算的仿真软件对系统进行模拟。分子动力学模拟 最常用的分子动力学仿真软件为LAMMPS，即为Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator的缩写。LAMMPS为美国Sandia国家实验室所开发的开...
LAMMPS 是一款经典的分子动力学软件,免费开源,可以模拟液态、固态或气态的粒子的系综。目前 LAMMPS 计算主要应用于:(1)研究金属材料的力学性能,LAMMPS 可以模拟金属材料的塑性变形和断裂行为,从而研究金属材料的力学性能。(2)研究高分子材料的分子构象,LAMMPS 可以模拟高分子材料的分子构象和分子运动,从而研究高分子材料...
分子动力学模拟是一种强大的工具,用于研究各种材料和系统的性质。LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一个广泛使用的软件包,特别适合处理大规模的分子动力学问题。 🔍 模拟对象: 纳米流体 聚合物 溶液 晶体 非晶无机物 金属 📊 可计算的物理量: 热导率 粘度 比热 动能 势能 📈...
扩散焊接LAMMPS分子动力学模拟 皮皮的小火车 501 0 利用LAMMPS 实现导热的分子动力学模拟 320科技工作室 417 0 基于MS Forcite模块的分子动力学研究药剂与矿物相互作用 320科技工作室 151 0 Gromacs分析处理-模拟前后蛋白结构差异对比图的制作 320科技工作室 77 0 利用RSoft的BPM算法对光波导和简单光波导器件...
天玑算丨分子动力学:基于贝叶斯和等变力场的超尺度反应分子动力学(MD+Lammps) 天玑算-科研服务 223 0 天玑算 | 分子动力学:两个多肽和蛋白的对接动力学模拟 天玑算-科研服务 250 0 天玑算丨第一性原理:sorption模块计算吸附的应用(DFT+Ms) 天玑算-科研服务 392 0 天玑算丨有限元:DPM颗粒喷枪喷雾模拟(FE...
lammpstube在 OVITO 软件中,用户可以使用“导出文件”功能创建用于分子动力学模拟的 LAMMPS 数据文件。生成的 LAMMPS 数据文件将包含运行分子动力学模拟所需的所有信息,包括原子坐标、元素类型、质量和盒子尺寸。通过在输入脚本中指定该文件,可以将其用作 LAMMPS 模拟的
LAMMPS分子动力学CPU算力性能测评实验案例模拟仿真科研电脑工作站·蒙特卡罗方法·5代至强铂金8500·i9-14900KS耐电王波析高性能计算机群 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多3572 -- 1:18 App Abaqus仿真CPU生产力R9-9900X战i9-14900KS测评实验Zen5架构锐龙9000性能·霄龙9354·epyc9684X·至强铂金三代...
1、B、使用L-J势模拟裂纹的扩展 L-J 无量纲化计算中的单位B、使用L-J势模拟裂纹的扩展裂纹lowerupperleftupperleftlowerxyLammps计算输入文件 # 2d LJ crack simulation(问题的基本初始化) dimension 2 #2维分子动力学模拟 boundary s s p #x,y方向不存在周期边界条件,z方向周期边界条件。 atom_style atomic...
正常情况下，分子动力学模拟要保证原子数目保持不变。nve、nvt、npt系综中的“n”就是原子数目，这些...
那我们就开始写in文件,开启LAMMPS模拟的第一步。根据上面说的分子动力学原理,那么第一步就是设置粒子的初始位置和速度?等等。在这之前我们还需要做一些前期准备工作。首先是设置单位制,即涉及到的物理量的单位都是什么。为什么要这么做呢?就是为了能够定量描述我们的对象。回想在高中的著名实验——小球平抛。我们怎么...