用MEG文件构建进化树,构建进化树结果保存为nwk类型即可。 2 MEME分析结果文件meme.xml 提供对应基因蛋白序列的motif结构信息。在Linux中安装MEME后,运行以下命令(如图二),我把命令的各部分解释给标记上了,可以根据需要灵活修改。这个命令的结果文件有好多个,找到xml文件(如图三)。 image.png 图二 image.png 图三 3...
用MEG文件构建进化树,构建进化树结果保存为nwk类型即可。 2 MEME分析结果文件meme.xml 提供对应基因蛋白序列的motif结构信息。在Linux中安装MEME后,运行以下命令(如图二),我把命令的各部分解释给标记上了,可以根据需要灵活修改。这个命令的结果文件有好多个,找到xml文件(如图三)。 image.png 图二 image.png 图三 3...
基因家族分析的论文中通常会把基因家族成员的进化树、基因结构、motif分析放在一张图里。效果如图一。准备这个图 除了把各部分画出来再使用ps将图片拼接起来以外,还可以用TBtools直接绘制这种效果的图片。其实绘制方法并不难,对于小白来说不友好的是准备绘图所需要的文件,本文旨在帮助像我一样刚入门的生信小白解决如何准...
用MEG文件构建进化树,构建进化树结果保存为nwk类型即可。 2 MEME分析结果文件meme.xml 提供对应基因蛋白序列的motif结构信息。在Linux中安装MEME后,运行以下命令(如图二),我把命令的各部分解释给标记上了,可以根据需要灵活修改。这个命令的结果文件有好多个,找到xml文件(如图三)。 image.png 图二 image.png 图三 3...