当时我的想法是用其他的方法建树,比如说linux中的程序包,IQ-TREE,FastTree,RaxML之类的,后来也是懒,想着试一下tbtools的建树,就找到One Step Build a ML Tree和IQ-Tree Wrapper。其中One Step Build a ML Tree更简单。 最后就跑出来了。 步骤如下: 1.搜索One Step Build a ML Tree 2.插入fasta序列或者txt...
在尝试使用mega11构建系统发生树后遇到运行闪退问题,我决定探索其他建树方法。考虑到效率和简便性,我选择尝试TBtools中的One Step Build a ML Tree和IQ-Tree Wrapper。其中,One Step Build a ML Tree因其简易操作更符合我当时的需要。在开始实际操作前,我首先通过搜索功能找到了One Step Build a ML...
新建文件夹进化分析1 包括 1多序列比对与可视化 Mega(Muscle)进行序列比对,JalView进行多序列比对结果的可视化 2进化树构建与可视化 氨基酸替代模型的选择,构建ML进化树(注意比对结果修剪参数...image.png 2进化树构建与可视化 2.1氨基酸替代模型的选择 2.2构建ML进化树 用最大似然法构建进化树 先建立模型, ? image....