在传统的图位克隆中,我们一般先利用BSA原理进行粗定位,寻找和突变表型连锁的marker,再在附近设计新的marker,利用作图群体进行精细定位,一步步缩小和突变表型连锁的染色体区段,直到鉴定出突变基因。MutMap的原理和图位克隆本质上是一样的,只不过把我们常规使用的marker换成了SNP,把通过PCR和酶切进行多态性鉴定,换成了...
MutMap作为基因定位的重要工具，其原理基于BSA（分离群体分组分析法）。通过对比不同表型的分离群体DNA，利用SNP和Indel作为marker，计算SNP频率，从而寻找与表型紧密连锁的染色体区域。这一方法在植物基因定位中尤为经典，如MutMap、MutMap+、MutMap-gap和QTL-seq等方法，适应于不同分离群体的基因定位需求。...
利用BSA(bulk-segregant analysis,分离群体分组分析)的原理,结合高通量全基因组重测序技术,以基因组中的SNP和Indel为marker,通过比对和计算SNP的频率,可以寻找和突变表型紧密连锁的染色体区域,并最终确认突变位点。其中,在植物中应用最经典的一个例子就是MutMap,并在此基础上发展出了MutMap+,MutMap-gap和QTL-seq,以...