转录组与代谢组联合分析是基于两个组学各自的标准分析结果,将差异基因和差异代谢物在代谢通路上的注释结果进行关联分析,可以在代谢通路上更好地解释转录调控机制。基于KEGG功能通路和基于表达量数据的关联分析是当前转录组+代谢组常用的两种分析策略。 1 基于K...
一、转录组+代谢组联合分析 转录组和代谢组是两种重要的生物学研究方法，他们分别研究基因转录的mRNA水平和生物体内代谢产物的变化。转录组是研究功能基因的利器，主要是测定某一时期生物体在特定条件下基因的表达谱，即对RNA进行鉴定和定量，表达谱能反映机体的生理状态，如通过分析差别表达情况，去判定机体癌症相关的...
一、转录组+代谢组联合分析 转录组和代谢组是两种重要的生物学研究方法,他们分别研究基因转录的mRNA水平和生物体内代谢产物的变化。 转录组是研究功能基因的利器,主要是测定某一时期生物体在特定条件下基因的表达谱,即对RNA进行鉴定和定量,表达谱能反映机体的生理状态,如通过分析差别表达情况,去判定机体癌症相关的病变...
图5 KEGG分析中富集的差异代谢途径 组学联合研究方案 欧易生物不仅提供基因、转录、表观、微生物、蛋白、代谢等全组学检测服务，而且在单细胞测序、空间多组学（空间代谢组、空间转录组、空间蛋白组）、单细胞蛋白组、多组学联合分析等方面亦有非常丰富的项目经验。欢迎有项目意向的老师扫描文末二维码咨询，欧易生物为您...
其中，转录组和代谢组的联合分析是一种常见的多组学研究方法。图1 转录组-代谢组关联分析流程图 一、 转录组和代谢组 PCA 比较分析 通过PCA方法，能够观察组内样本的聚集程度和组间样本的总体分布趋势，然后比较不同的组学的分布趋势的异同和变化。利用全部的基因与代谢物进行PCA的绘制。图2 转录组和代谢组的PCA...
单细胞转录组在细胞水平上展示了细胞中转录本差异变化,而代谢组则表征了组织中代谢物的差异变化,同时使用两种组学联合分析,可同时掌握细胞内的基因调控机制和代谢物丰度变化,揭示其间更深刻的分子机制。 多组学联合分析是发表高分文章的必要策略,高分文章更是产出不断!接下来,为大家分享6篇经典的“单细胞转录组+代谢组...
代谢组与转录组联合分析的方法 1)基于代谢通路分析的关联分析 基于两组变化显著的基因和代谢物共同富集到的通路关系,可能在一条或几条通路中基因的表达水平发生改变导致下游的代谢物水平同时发生变化,最终影响到生物体表型发生明显变化,这样可以说明基因和代谢物及表型之间的直接关系。对共有通路使用气泡图展示其通路的...
一、转录组+代谢组联合分析 转录组和代谢组是两种重要的生物学研究方法,他们分别研究基因转录的mRNA水平和生物体内代谢产物的变化。 转录组是研究功能基因的利器,主要是测定某一时期生物体在特定条件下基因的表达谱,即对RNA进行鉴定和定量,表达谱能反映机体的生理状态,如通过分析差别表达情况,去判定机体癌症相关的病变。
多组学技术可以通过对生物多种组学进行分析,从而对不同层次分子在生命系统里的功能进行联合探究。转录组和代谢组是生物学研究中常用的两种高通量技术,转录组分析用于了解基因在不同条件下的表达情况,代谢组分析则可以揭示代谢物在不同条件下的变化。两种技术的结合可以更全面地...
目前,转录组和代谢组的联合分析主要分为两大部分,一是寻找共同的KEGG通路和富集功能;二是进行相关性的关联分析。将差异基因和差异代谢物在KEGG上共同富集的基因和代谢物进行联合分析,并计算差异基因和差异代谢物的相关性,构建相关性网络,可以找出引起代谢物发生变化的关键作用基因,确定关键的调控通路。