网络连接不稳定：学校的网络可能存在不稳定的情况，导致下载过程中断。您可以尝试使用其他网络环境，例如家...
ascp快速下载NCBI各种数据库种的数据 NR NT 数据库: #wget -c https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/taxdump.tar.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2acc_lmdb.db.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2...
一、NCBI的nr数据库数下载总是中断的原因 1、网络连接问题 下载过程中,如果你的网络连接不稳定或遇到中断,下载可能会中断。这可能是由于网络问题、服务器问题或中间设备故障等原因造成的。尝试在网络连接较好的环境下进行下载,或者检查网络连接是否正常。 2、下载限制和防火墙 有些网络环境可能设置了下载限制或防火墙规...
NR数据库:ascp -i ~/asperaweb_id_dsa.openssh -QTr -l500m anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:blast/db/FASTA/nr.gz ./ 其他的下载地址可以参考该下载命令,只要稍加修改即可,参数-i表示限制的最大下载速度,一般200m到500m,其他参数小编了解的不是很清楚,感兴趣可以去官网上翻阅。 aspera的其他应用 对于生...
因为nr库很大啊，一定要断点续传，Windows下最好用ftp客户端下载，linux下wget -c -t 0 ...
为什么Synchronized不可中断？首先中断操作是Thread类调用interrupt方法实现的。基本上所有人都说Synchronized后...
关键词:ascp; NCBI; nr数据库; Aspera 之前下载NCBI NR数据库,ascp失效,查询NCBI官网关于Ascp的使用方法:https://www.ncb...
NCBIaspera 下载命令: /root/.aspera/connect/bin/ascp -QT -l /root/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/FASTA/nr.gz . 300m -k1 -i SRA 下载方式: 1、通过 sratoolkit,可以直接下载成 fastq 格式,速度比 ftp 快,比 aspera 慢。 /data/soft/...
2.ncbi中SRA的ftp下载链接为: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/, SRA数据库的格式为: 戈贝尔光和热 2018/12/27 9230 RNA-seq(2)-1:原始数据下载的几种方法 其他 第1选择--Aspera Connect 如果aspera connect不能下载,推荐sratoolkit的prefetch功能。尽量不要用wget或curl下载,速度慢,且有时下载不完全 ...
ncbi数据库作为多组学的核心数据库之一在生物信息雪过程中起着重要作用。nr和nt数据库也在逐渐庞大。目前需要用几十或者几百个G来衡量了。面对外国的服务器,我们下载数据库成了巨大的问题。早在10年前就有人提议建立国内镜像。如今到是有几个不成熟的镜像。今天的nr数据库我就在这仅有的镜像里也下不下来。ncbi...