新格元单细胞转录组二代+三代解决方案,利用GEXSCOPE®平台对单细胞mRNA捕获后进行反转录生成cDNA,利用同一份cDNA分成两部分,分别构建二代测序文库和三代测序文库,流程优化简单,二、三代单细胞优势互补,大幅降低整体实验成本,为单细胞全长转录组测序提供了一站式解决方案。并且在数据分析上相较于单独的单细胞二代或...
◆测序平台:PacBio Sequel 02 测序产品:满足更多测序需求 1. 全转录组测序 全转录组是指特定组织或细胞在特定状态下转录出来的所有RNA的总和,借助高通量测序技术可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源机制,进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。 (1)全转录组即特定细胞或组织在某一功能状态下转录产物 (...
同一份cDNA被分为两部分,分别构建二代和三代测序文库,实现了流程的优化和简化。这种二、三代测序的互补策略大幅降低了实验成本,为单细胞全长转录组测序提供了一站式解决方案。在数据分析方面,二代+三代测序的结合使得细胞聚类和细胞注释更加精确。同时,三代测序的超长读长为我们提供了mRNA的全长序列和结构信息。 ...
第三代测序技术Pacbio利用单分子实时测序(SMRT, single molecular real time sequencing)技术,无需组装即可直接获取5’端到3’端完整的全长转录本,具有超长的读长,因此可得到更高质量的转录本,有利于mRNA结构的研究,如可变剪切、融合基因、等位基因表达等。 全长转录组的研究越来越热门,联合二代转录组测序更是成为...
三代全长+二代测序+蛋白 通过三代鉴定得到isoforms,增加新的转录本信息;二代分析可用于对转录本定量及差异分析;蛋白质组证明哪个可变剪接形成的转录本被翻译成了蛋白质,及不同可变剪接形式所产生的蛋白丰度变化。 联合蛋白组研究脱落酸处理拟南芥的转录和翻译分子机制[4] ...
这些三代全长转录组测序的相关问题,可以帮到爱学习的我哦 1.什么是三代全长转录组测序 三代全长转录组测序,即利用PacBio三代测序平台对某一物种的mRNA进行测序研究。它以平均超长读长10-15kb的优势、结合多片段文库筛选技术,实现了无需拼接的转录本分析,克服了传统二代
三代全长转录组测序,又称为iso-seq,是基于Pacbio三代测序平台进行的mRNA测序研究。这种技术以其超长读长的特点著称,无需打断和拼接,便能捕获到完整的5’和3’UTR,以及ploy A tail。这一方法克服了传统二代测序的短板,如较短的读长、转录本拼接的不完整性,从而能够揭示单个mRNA分子从5’到3’端的高质量转录...
基于ONT三代测序平台进行全长转录组测序,除了可准确鉴别上述转录本结构变异,由于现阶段测序成本和通量(相对于PacBio平台),还可实现转录本(mRNA或polyA+ lncRNA)表达水平准确定量和差异分析。 图1. 三代转录组测序之于二代测序的优势 Park, Eddie et al
RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...