T/CHIA41-2023《非编码RNA注释标准》分为以下3个部分: 第1部分:分类信息: 第2部分:基本信息注释: 第3部分:功能及疾病注释。 本部分为T/CHIA41-2023的第1部分。 本部分按照GB/T1.1-2020给出的规则起草。 本部分由中国科学院生物物理研究所提出,由中国卫生信息与健康大数据学会归口。 本
==protein_coding"表示只从文件中提取出类别不为protein_coding的即非编码RNA的所有行 运行完成的结果 提取到了RNA类型为ncRNA的id.col(基因名称列)和probe_id(探针id列)这两列注释信息,同时生成的这个结果文件名的文件名有点长,需要我们重命名一下文件名的名字,我把这个结果文件最终命名成了ncrna_gene_anno_sub...
以下是一个基本的非编码RNA注释流程: 1.数据准备: 收集待注释的RNA序列数据,可以是转录组测序数据、基因组序列数据或其他相关数据。 准备参考基因组序列和相关的基因注释信息,以便进行比对和注释。 2.序列比对: 使用合适的序列比对工具,将待注释的RNA序列与参考基因组进行比对。 比对可以采用全局比对或局部比对算法,...
ICS 35.240.80C 07团体标准TCHIA 41.12023RNA1Specifications for annotation of noncoding RNA Part 1:Classification information2
长非编码RNA(Long noncoding RNAs,lncRNA)是一类新型调控分子,近期研究发现其在从胚胎发育到肿瘤发生等多种生理病理过程中发挥核心调控作用[1–5]。因此,随着越来越多的长非编码RNA被鉴定[6, 7],一批计算工具应运而生,为生物学家预测l...
T/CHIA 42.3-2023 长非编码 RNA 和蛋白相互作用注释标准 第 3 部分: 长非编码 RNA 及其相互作用蛋白 质的功能注释 格式:PDF 页数:11 上传日期:2024-12-31 11:43:58 浏览次数:2 下载积分:1000 加入阅读清单 0%还剩10 页未读,是否继续阅读?
长非编码 RNA(lncRNA)是其中最大的一类,其转录本长度大于200个核苷酸。虽然一些 lncRNA 已被证 明是调控基因表达和 3D 基因组结构的重要元 件,但是大部分 lncRNA 还未被研究和注释。本 课题组利用大量基因组数据,提出一些基于数据...
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA。大量研究表明,lncRNA具有重要的调控功能,在植物和动物的各种生物学过程中起着重要作用。此外,lncRNA还与人类各种疾病的发生发展密切相关。因此对lncRNA的注释、探索lncRNA的功能具有非常重要的意义。近年来,很多研究都集中于lncRNA功能的探索...
《T/CHIA 41.3-2023 非编码RNA注释标准 第3部分:功能及疾病注释》标准下载.本标准规定了非编码RNA注释中关于功能部分以及与疾病关系的注释。本标准适用于对非编码RNA注释。
NSAM-04:基因组注释-非编码RNA分析 本方案将对一些重要的非编基因进行注释,包括:miRNA、tRNA、snoRNA。针对功能重要的miRNA和snoRNA,在没有直接RNA数据的情况下,我们将适当选择非编码基因数据库,采用同源方法其基因进行注释。 (1)鉴定miRNA 鉴于miRNA在结构上的显著特点,对于miRNA的预测将分为两个部分,分别为同源搜索...