T CHIA 41.1—2023 非编码RNA注释标准 第1部分:分类信息.pdf,ICS 35.240.80 C 07 团体标准 T/CHIA 41.1-2023 .2-2020 非编码RNA 注释标准 第1 部分:分类信息 Specifications for annotation of non-coding RNA Part 1 Classification information : 2023-11-14 发布
对非编码RNA进行注释是理解其功能和机制的关键步骤。本文将详细阐述非编码RNA的注释流程。 1. 数据获取:首先,我们需要获取非编码RNA的序列数据,这通常来自于高通量测序技术,如RNA-seq或small RNA-seq。这些数据可以是公开的,也可以是实验室自己产生的。 2. 预处理:数据预处理包括质量控制、 adapter修剪、低质量...
==protein_coding"表示只从文件中提取出类别不为protein_coding的即非编码RNA的所有行 运行完成的结果 提取到了RNA类型为ncRNA的id.col(基因名称列)和probe_id(探针id列)这两列注释信息,同时生成的这个结果文件名的文件名有点长,需要我们重命名一下文件名的名字,我把这个结果文件最终命名成了ncrna_gene_anno_sub...
长非编码RNA(Long noncoding RNAs,lncRNA)一般指长度大于200bp且不具有编码蛋白质功能的RNA。长非编码RNA是重要的调控分子,在发育和疾病等多种过程中发挥着重要的调控作用,有望成为药物靶标和疾病诊断的标志物。 lncRNA通常可以根据与邻近编码基因的位置关系来分类 北京大学生物医学前沿创新中心 (BIOPIC)、生物信息中...
长非编码RNA(Long noncoding RNAs,lncRNA)是一类新型调控分子,近期研究发现其在从胚胎发育到肿瘤发生等多种生理病理过程中发挥核心调控作用[1–5]。因此,随着越来越多的长非编码RNA被鉴定[6, 7],一批计算工具应运而生,为生物学家预测l...
长非编码RNA(Long noncoding RNAs,lncRNA)是一类新型调控分子,近期研究发现其在从胚胎发育到肿瘤发生等多种生理病理过程中发挥核心调控作用[1–5]。因此,随着越来越多的长非编码RNA被鉴定[6, 7],一批计算工具应运而生,为生物学家预测lncRNA的GO功能和调控网络[8]、亚细胞定位[9,10],乃至lncRNA-RNA[11]、ln...
长非编码 RNA(lncRNA)是其中最大的一类,其转录本长度大于200个核苷酸。虽然一些 lncRNA 已被证 明是调控基因表达和 3D 基因组结构的重要元 件,但是大部分 lncRNA 还未被研究和注释。本 课题组利用大量基因组数据,提出一些基于数据...
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA。大量研究表明,lncRNA具有重要的调控功能,在植物和动物的各种生物学过程中起着重要作用。此外,lncRNA还与人类各种疾病的发生发展密切相关。因此对lncRNA的注释、探索lncRNA的功能具有非常重要的意义。近年来,很多研究都集中于lncRNA功能的探索...
哺乳动物的基因组中能转录出成千上万的长链非编码RNA(lnc RNA),这些新发现的RNA分子已经被证实参与了各种各样复杂的生物过程.目前大多数哺乳动物的lnc RNA的参考注释并不完全,这限制了对lnc RNA的进化以及接下来的功能研究.本研究组利用9个物种6种组织的转录组测序数据,成功地构建出一个完备的哺乳动物lnc RNA的...