“如此大的数据处理和比较还需要很强的计算生物学资源,以及敏锐细致的操控能力。”王文补充道,非洲肺鱼基因组不仅是目前解析的最大基因组,也是首个完整且高质量的超大基因组,染色体挂载率达99%以上。“这样一来,基因组解析技术得到了前所未有的跃升,今后基因组领域的相关研究需要达到的标准也会有所提高。”肺鱼超大基因组之谜 非洲肺鱼基
“肺鱼拥有已知脊椎动物中最庞大的基因组,长期以来科学家们都未能解析成功,使脊椎动物从水生到陆生的研究缺失了一个关键环节。”论文通讯作者之一、西北工业大学教授王文告诉《中国科学报》。 非洲肺鱼基因组也许在各种肺鱼中是最小的,但其基因组大小至少是人类的13倍,高达400多亿对碱基。因此,肺鱼基因组解析的工作量...
研究团队进行了非洲肺鱼(Protopterus annectens)基因组的40Gb染色体级组装。这是迄今公布的最大的脊椎动物基因组的染色体级组装。连接体和染色体N50甚至分别达到了1.60 Mb和2.81Gb。 肺鱼基因组的大尺寸主要是由于逆转录酶的作用。超长的基因表现出与其他基因相似的表达水平,说明肺鱼进化出了高转录效能,以保持基因表达...
研究团队进行了非洲肺鱼(Protopterus annectens)基因组的40Gb染色体级组装。这是迄今公布的最大的脊椎动物基因组的染色体级组装。连接体和染色体N50甚至分别达到了1.60 Mb和2.81Gb。 肺鱼基因组的大尺寸主要是由于逆转录酶的作用。超长的基因表现出与其他基因相似的表达水平,说明肺鱼进化出了高转录效能,以保持基因表达...
介绍了大规模非洲肺鱼基因组的基因组组装和分析,揭示了从水到陆地的转变所需的遗传 创新 1. 迄今为止报道的最大脊椎动物基因组的染色体水平组装 2. 转座子的持续扩展促成了巨大的肺鱼基因组 3. 遗传变化增强了呼吸、运动和抗焦虑能力 4. 从硬骨鱼到肺鱼,再到四足动物经历了三个遗传创新步骤 ...
研究团队进行了非洲肺鱼(Protopterus annectens)基因组的40Gb染色体级组装。这是迄今公布的最大的脊椎动物基因组的染色体级组装。连接体和染色体N50甚至分别达到了1.60 Mb和2.81Gb。 肺鱼基因组的大尺寸主要是由于逆转录酶的作用。超长的基因表现出与其他基因相似的表达水平,说明肺鱼进化出了高转录效能,以保持基因表达...