“如此大的数据处理和比较还需要很强的计算生物学资源，以及敏锐细致的操控能力。”王文补充道，非洲肺鱼基因组不仅是目前解析的最大基因组，也是首个完整且高质量的超大基因组，染色体挂载率达99%以上。“这样一来，基因组解析技术得到了前所未有的跃升，今后基因组领域的相关研究需要达到的标准也会有所提高。”肺鱼...
尽管非洲肺鱼和美西螈具有独立的基因组扩增,但它们都具有大量的RVT_1结构域(图2C),编码逆转录酶,该酶总是由反转录转座子携带. 在266种脊椎动物中,RVT-1的数量与基因组大小呈正相关(表S3),在非洲肺鱼中有超过5.2百万个,而在小鼠中只有61631个,这意味着反转录转座子是基因组扩增的主要驱动力。这些RVT_1结构...
“肺鱼拥有已知脊椎动物中最庞大的基因组,长期以来科学家们都未能解析成功,使脊椎动物从水生到陆生的研究缺失了一个关键环节。”论文通讯作者之一、西北工业大学教授王文告诉《中国科学报》。 非洲肺鱼基因组也许在各种肺鱼中是最小的,但其基因组大小至少是人类的13倍,高达400多亿对碱基。因此,肺鱼基因组解析的工作量...
研究团队进行了非洲肺鱼(Protopterus annectens)基因组的40Gb染色体级组装。这是迄今公布的最大的脊椎动物基因组的染色体级组装。连接体和染色体N50甚至分别达到了1.60 Mb和2.81Gb。 肺鱼基因组的大尺寸主要是由于逆转录酶的作用。超长的基因表现出与其他基因相似的表达水平,说明肺鱼进化出了高转录效能,以保持基因表达...
西北工业大学王文联合多机构发布非洲肺鱼基因组研究 高阶元生物类别的起源历来是进化生命科学的核心命题。包括人类在内的脊椎动物谱系总根底起源,涉及到脊椎动物两大类群间的演化关系。这不仅是学术界长期探索的一个焦点问题,也是大众普遍关注的一个科学热点。
西北工业大学王文联合多机构发布非洲肺鱼基因组研究 高阶元生物类别的起源历来是进化生命科学的核心命题。包括人类在内的脊椎动物谱系总根底起源,涉及到脊椎动物两大类群间的演化关系。这不仅是学术界长期探索的一个焦点问题,也是大众普遍关注的一个科学热点。
西北工业大学王文联合多机构发布非洲肺鱼基因组研究 高阶元生物类别的起源历来是进化生命科学的核心命题。包括人类在内的脊椎动物谱系总根底起源,涉及到脊椎动物两大类群间的演化关系。这不仅是学术界长期探索的一个焦点问题,也是大众普遍关注的一个科学热点。
肺鱼是现存动物中最接近四足动物的近亲,并保留了与水到陆地过渡有关的祖先特征。然而,它们巨大的基因组大小阻碍了对进化中这一关键转变的理解。 研究团队进行了非洲肺鱼(Protopterus annectens)基因组的40Gb染色体级组装。这是迄今公布的最大的脊椎动物基因组的染色体级组装。连接体和染色体N50甚至分别达到了1.60 Mb和...