基因表达调控主要由顺式调控元件 (CRE) 介导,其在调节各种生物过程中的基因功能中发挥着关键作用。 CRE 通常包含转录因子 (TF)的特异性结合位点。 TF 结合的 DNA 片段通常缺乏核小体,并且两侧是活性组蛋白标记 。远端 CRE,特别是增强子,与其目标启动子进行物理相互作用,有时以多边方式。尽管它们在创建细胞类型特异性转录组方面发
本文将从基本概念入手,介绍转录因子和转录调控元件的意义及其识别方法,并探讨它们在基因表达和细胞信号转导中的功能分析。 一、转录因子和转录调控元件的基本概念 转录因子是一类能够与DNA片段结合并调控基因表达的蛋白质,其主要作用是在RNA聚合酶进入启动位点前结合DNA并调节基因的转录。转录因子可以通过既定的DNA序列与...
根据甘蓝和油菜基因组数据库信息,同源克隆到BnFAD2-C1基因的启动子(promoter)和内含子(intron)序列,并通过PLACE和PlantCARE网站分析,初步预测到调控该基因转录的潜在顺式作用元件。通过茉莉酸诱导处理, BnFAD2-C1基因表达量发生变化,推断茉莉酸在BnFAD2-C1基因的表达过程中可能发挥一定的调控作用。doi:CNKI:SUN:XBZW...
2004-基于基因组数据的转录调控元件分析
造成启动子活性从最高到消失表明 该区域对山羊 ;E61 基 因转录调控有重要影响生物信息学分析发现该区域 存在 2 个转录因子结合位点利 用点突变构建了 2 个突变载体经过双荧光素酶检测发现2个突变载体的活性均显著下降提示这2个转录因子是山羊 ;E61 基因转录的正 调控元件本 研究确定了山羊 ;E61 基因...
的几个 元件(CpG 岛(CpG island),TATA 框 (TATA boX),CAA T 框(CAAT box)和 GC 框(oc box))在小 鼠 基因内含子中的出现情况 。我们的分析结果对基因转 录调控区域的选择及内含子功能的认识有重要意义。 1 结果与分析 1.1 CpG 岛在内含子中的出现频率分析 CpG 岛和基 因的表达或转录调控有...
拟南芥 基因启动子的克隆及转录调控元件分析 * 李 宏， 魏鹏程， 龚喜明， 王学臣 ** （中国农业大学生物学院植物生理生化国家重点实验室， 北京 100094）关键词：拟南芥 启动子； 顺式作用元件； 转录调控 中图分类号:S188 文献标识码: A 文章编号: 10061304(2008)03054302 Cloning and Analysis ...
目的获得五指山猪内源性反转录病毒5'端非编码区(5'UTR)cDNA,分析其一级结构和调控元件,为进一步研究其在PERV复制、转录中的调控机制奠定基础.方法采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)克隆来源于五指山猪的内源性反转录病毒(PERV-WZS)5'UTR,并通过NCBI公共数据库BLASTN序列进行同源性分析,应用KEGG数据库对该转录调控区...
轻松搞定转录因子研究! | 🌟转录因子(TF)是一类能够与DNA上特定基序结合并调节基因转录的蛋白。 🌟作为反式作用因子,转录因子通过结合基因组(如启动子、增强子等)上顺式作用元件,从而调节基因的转录激活或抑制。 🌟转录因子功能:•结合启动子序列,帮助形成转录起始复合物•结合增强子序列,激活基因转录•先驱...
如何证明基因需要转录调控元件调控表达如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3) 加入特定的荧光素...