顺式调控元件(CRE)对于协调不同生物系统中的基因表达至关重要。功能性 CRE 的准确识别和深入表征对于解码细胞过程中的基因调控网络至关重要。在本研究中,开发了酮醛酸辅助单链 DNA 转座酶可及染色质测序分析 (KAS-ATAC-seq),以定量分析CRE 的转录活性。 KAS-ATAC-seq 的主要优势在于其精确测量近端和远端 ATAC-...
本文将从基本概念入手,介绍转录因子和转录调控元件的意义及其识别方法,并探讨它们在基因表达和细胞信号转导中的功能分析。 一、转录因子和转录调控元件的基本概念 转录因子是一类能够与DNA片段结合并调控基因表达的蛋白质,其主要作用是在RNA聚合酶进入启动位点前结合DNA并调节基因的转录。转录因子可以通过既定的DNA序列与...
2004-基于基因组数据的转录调控元件分析
转录调控目的 对hNaDC1基因启动子序列转录调控元件进行初步分析.方法 构建hNaDC1基因5'侧翼序列系列缺失质粒,以双荧光素酶报告基因检测系统检测hNaDC1基因5'侧翼区(-2 232/+136)的转录调控元件与转录调控蛋白之间的相互作用.结果 pGL3-hNaDC1A质粒的转录活性最高,为(2.98±0.45);pGL3-hNaDC1D的转录活性最低,...
中国畜牧兽医 2022,49(4):1213-1222China Animal Husbandry &Veterinary Medicine绵羊 CCL19 基因启动子活性分析及其转录调控元件筛选翟 哲1,陈 思1,吴艳茹 1 ,王雪梅 1 ,李崇瑞 1 ,刘志勇1 ,陈巧玲 1 ,王凤阳 1,杜 丽1,李 昌2 ,金宁一 2(1.海南大学动物科技学院,海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验...
未知转录调控元件. 为进一步了解 RP 基因的转录调控规律,利用频率比较分析方法和 Z-score 统计量,在人 RP 基因启动子序列中抽提出一批高频出现(over-represented)的 DNA 词(亦称模体). 其中大部分模体与 TRANSFAC 数据库中收集的人基因转录因子结合位点(transcriptional factor binding sites,TFBSs)吻合. 分析表明,...
1.3 基于原生质体瞬时表达的启动子活性分析制备烟草 2.2 根据基因启动子的切除分析基因启动子中可能的转录因子结合元件启动子活性不同,其中 282bp 长的段连接的(图 2)基因, 表达活性最高 和启动子片 区间中正常培养 36h 后进行不同处理。光处理:光强为 120～130 2 /s, 4 ℃冰箱中培养 8 h。ABA 处 培养...
转录调控元件高通量筛选标志物真核生物的基因表达是一个非常复杂的过程,需要多种转录调控元件的协同作用精确调控.全基因组转录调控元 件的筛选和鉴定对于基因表达调控机制和生物学功能研究具有重要意义.但转录调控元件的高效筛选及功能验证仍是研究人员面临的主要挑战.结合近年来转录调控 元件的研究成果,对基因组中转录调...
拟南芥 基因启动子的克隆及转录调控元件分析 * 李 宏， 魏鹏程， 龚喜明， 王学臣 ** （中国农业大学生物学院植物生理生化国家重点实验室， 北京 100094）关键词：拟南芥 启动子； 顺式作用元件； 转录调控 中图分类号:S188 文献标识码: A 文章编号: 10061304(2008)03054302 Cloning and Analysis ...
2.2 基因启动子的切除分析根据基因启动子中可能的转录因子结合元件分布,对其进行截短分析,结果表明,不同位置和长度的启动子活性不同,其中282bp长的启动子片段连接的基因,表达活性最高(图2)。和区间中可能存在一个转录抑制子。TATAbox及转录起始位点的下农业生物技术学报 2008年游序列对RNA聚合酶有效的转录同样起到...