该篇文献作者通过单细胞转录组测序和单细胞核转录组测序的数据比较,系统的评估了高通量单细胞和单细胞核RNA-seq的差异,文献展示了人体诱导多能干细胞(iPS细胞)分化成心肌细胞的时程中所有细胞和细胞核的转录组图谱。通过对Drop-seq和DroNc-seq的不同时间点转录组数据的聚类发现了六个不同的细胞类型,其中五个在这...
转录苗期rnaseqnovo组装teosinte 分类号华中农业大学硕士学位论文密级大刍草苗期转录组RNA-Seq数据的Denovo组装和分析DenovoAssemblyandAnalysisofTeosinteSeedlingTranscriptomeDefinedbyRNA--Seq研究生:肖之夏指导教师:**琏教授指导小组:张祖新教授高友军讲师专业:生物化学与分子生物学研究方向:玉米分子生物学获得学位名称:理学...
RPKM与FPKM的区别:RPKM值适用于单末端RNA-seq实验数据,FPKM适用于双末端RNA-seq测序数据。 3.TPM (Transcript per million) TPM(Transcripts Per Million) 是一种常用的基因表达量归一化方法,它将基因的表达量调整为每百万条转录本的数量。TPM 值考虑了基因的长度和测序深度,通过将每个基因的 Counts 值除以其长度,...
转录组分析我们从以下四个部分展开:数据获取和预处理转录本定量差异表达分析功能富集分析参考序列比对:在RNA测序数据分析中,由于可变剪切的存在,对reads进行splice比对是至关重要的。推荐使用 hisat2 和 STAR 这两个工具进行splice比对,适合处理二代测序RNA-Seq数据。对于三代测序RNA-Seq数据,可以考虑使用 minimap2 或...
金十数据9月12日讯,华大智造官微消息,日前,华大智造在香港、深圳两地举办了2024Omics前沿大会。在香港会场,华大智造面向全球推出一款由αLab孕育孵化的AI大模型产品αLabStudio智能实验室管理平台。在深圳会场,华大智造重磅推出升级版时空转录组FF产品方案(freshfrozen冷冻样本)Stereo-seqv1.3和DNBelabC系列高通量单细...