采用2代测序技术,对水貂(Mink,Mustela lutreola)外周血白细胞转录组进行了RNASeq测序、de novo拼接和信息比对研究。结果表明:转录组测序共得到了3.1 GB的原始数据,共32245804个reads,去除载体信息的数据量为28797350个read...
该篇文献作者通过单细胞转录组测序和单细胞核转录组测序的数据比较,系统的评估了高通量单细胞和单细胞核RNA-seq的差异,文献展示了人体诱导多能干细胞(iPS细胞)分化成心肌细胞的时程中所有细胞和细胞核的转录组图谱。通过对Drop-seq和DroNc-seq的不同时间点转录组数据的聚类发现了六个不同的细胞类型,其中五个在这...
为从转录组水平上分析貉免疫分子相关信息,深入了解并研究其免疫防御机制,本研究采用2代测序技术,对貉外周血单核细胞(PBMCs)进行了RNA-Seq测序,de novo拼接和信息比对研究.结果表明,转录组测序共得到3.1 GB的原始数据,共32 245 804个读长,去除载体信息的数据量为28 797 350个读长.经质量控制和de novo拼接后,对...
RPKM与FPKM的区别:RPKM值适用于单末端RNA-seq实验数据,FPKM适用于双末端RNA-seq测序数据。 3.TPM (Transcript per million) TPM(Transcripts Per Million) 是一种常用的基因表达量归一化方法,它将基因的表达量调整为每百万条转录本的数量。TPM 值考虑了基因的长度和测序深度,通过将每个基因的 Counts 值除以其长度,...