目的通过生物信息学方法,分析E2F转录因子在子宫内膜癌中的表达及意义.结合表达差异基因和富集通路,预测子宫内膜癌的潜在生物标志物.方法使用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI),共表达网络,分析E2F在子宫内膜癌中的表达.筛选癌组织和癌旁组织差异表达的E2F基因,对差异基因进行生物过程(GO)分析和KEGG富集分析.单因素Cox分析...
通过分析转录因子与特定基因启动子或调控元件的结合能力,可以揭示基因调控网络和转录调控机制。2.RNA结合蛋白研究:EMSA可用于研究RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)与RNA的相互作用。通过探究RBPs与目标RNA序列的结合,可以了解RBPs在转录后调控、RNA稳定性和翻译调控等过程中的功能。3.DNA修复和损伤识别:EMSA可...
预后目的通过生物信息学方法分析转录因子E2F家族(E2Fs)在头颈部鳞癌(HNSCC)中转录水平(mRNA)的表达,探究其在HNSCC发病中的作用.方法利用TCGA,GEPIA2和UALCAN公共数据库分析E2Fs mRNA在HNSCC中的表达及其与患者总生存期的关系,利用cBioPortal公共数据库筛选E2Fs的共表达基因构建共表达网络,通过R软件分析E2Fs及其共表...
胰腺癌信使RNA预后目的基于在线数据库分析阐明E2F转录因子家族成员mRNA在胰腺癌组织中的表达水平及其在胰腺癌患者中的预后意义.方法利用基因表达谱交互式分析(GEPIA)在线分析数据库,采用Mann-Whitney U检验及Kaplan-Meier生存分析的统计学方法分别分析E2F转录因子家族成员mRNA在179例胰腺癌与171例癌旁组织的差异性表达,分析...