(7)蛋白质组学和转录组学结果之间的相关性 比对二次刺激后MRL/lpr小鼠BMDM中显著上调的基因和蛋白质(所有三个比较中上调的DEG和DEP),发现5个分子(Calhm6,Isg15,Gbp2,Iigp1,Ifi47)在转录组和蛋白质组中一致上调,而1个分子(Samhd1)在蛋白质组中下调,在转录组中上调。 表1 显示转录组和蛋白质组相关性的...
对基于iTRAQ的数据的分析揭示了八个被注释为参与脂肪酸代谢的转录因子的DAP,并且属于AP2和HDZIP家族的蛋白质都被下调。 为了阐明与油茶种子成熟相关的蛋白质种类之间的可能关系,基于拟南芥的数据生成了PPI网络。给定可视化图像的潜在大小,从整个网络中进一步提取特别感兴趣的相互作用蛋白质,并构建两个复杂的子网络(图7B...
基于微流控纳升级超微量样品操作技术、深度单细胞蛋白质组分析技术和单细胞转录组测序技术,发展了单细胞同时转录组和蛋白质组(Single-cell simultaneous transcriptome and proteome, scSTAP)分析技术,首次实现针对同一单细胞个体转录组和蛋白质...
然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研究组、研究员张维绮研究组和中科院动物研究所研究员刘光慧研究组、研究员曲静研究组,合作建立Aging Atlas数据库。该数据库从常规转录组、单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组及药物基因...
图8 差异蛋白的注释和富集分析 (7)蛋白质组学和转录组学结果之间的相关性 比对二次刺激后MRL/lpr小鼠BMDM中显著上调的基因和蛋白质(所有三个比较中上调的DEG和DEP),发现5个分子(Calhm6,Isg15,Gbp2,Iigp1,Ifi47)在转录组和蛋白质组中一致上调,而1个分子(Samhd1)在蛋白质组中下调,在转录组中上调。
教授团队与浙江大学良渚实验室王永成团队和傅旭东团队合作,基于微流控纳升级超微量样品操作技术、深度单细胞蛋白质组分析技术和单细胞转录组测序技术,发展了单细胞同时转录组和蛋白质组(Single-cell simultaneous transcriptome and proteome, scSTAP)分析技术,首次实现针对同一单细胞个体转录组和蛋白质组深度联合定量分析。