非变性质谱中的蛋白质-小分子相互作用 4. 结构分析的离子活化方法 4.1 碰撞诱导解离 4.2 表面诱导解离 4.3 电子解离技术(ExD) 4.4 紫外线光解离 参考文献 非变性质谱中的蛋白质-小分子相互作用 Protein−Small Molecule Interactions in Native Mass Spectrometry Jack L. Bennett, Giang T. H. Nguyen, William...
1.静电作用(电荷-电荷相互作用): 这是由相反电荷之间的吸引(例如,阳离子和阴离子之间)或相同电荷之间的排斥引起的。 在蛋白质与带电小分子之间,这种作用通常非常显著,并能显著影响结合亲和力。 2.疏水作用(疏水相互作用): 当非极性分子或分子的非极性区域在水性环境中聚集时,会发生疏水作用。
随着质谱检测器与微流控系统耦合的进一步发展,很可能会出现几个用于分析非变性质谱中蛋白质-小分子相互作用的高通量平台。 ——除了数据收集的自动化,非变性质谱测量的分析也必须经过编程化,使研究人员能够快速处理筛选活动产生的大数据集。先前使用非变性质谱进行片段筛选的研究强调,缺乏可用的软件工具是该技术的一个...
小分子与蛋白质的相互作用机制通常包括以下几个方面: 1.氢键作用 氢键作用是指小分子与蛋白质中氢原子之间通过电荷分布不均而发生的相互作用。氢键作用是相对强力的相互作用。通常情况下,氢键会在小分子和蛋白质之间形成氢键桥,从而维持它们之间的亲和力,发挥作用。 2.疏水作用 疏水作用是指小分子与蛋白质之间通过分子...
小分子则是生命体内重要的调节因子,它们能够通过与蛋白质的相互作用来调节蛋白质的结构和功能。本文将简要介绍蛋白质和小分子相互作用的几种基本形式,并重点讨论了目前研究中发现的一些重要调控机制。 一、蛋白质和小分子相互作用的基本形式 蛋白质和小分子之间的相互作用可以分为几种基本形式,其中最为常见的包括以下...
在生物化学领域,衡量蛋白质与配体之间的相互作用通常涉及到三个关键的生化指标:Kd值、Ki值及Km值。这些指标对于理解生物分子之间的相互作用机制至关重要。Kd值,即解离常数,描述的是蛋白质与小分子(如LAC等)之间的结合强度。单位为摩尔浓度(M),其值越小表示结合力越强,意味着蛋白质与小分子的...
非变性质谱(Native MS)是分析蛋白质-小分子相互作用的一种强大而通用的生物物理方法【18-27】。通过检测气相中完整的蛋白-配体复合物,非变性质谱可以用来确定配体结合的化学计量学和特异性【28】、量化解离常数【29】并研究抑制剂的作用机理【30,31】。 ——自21世纪初以来,非变性质谱已被应用于制药领域,用于蛋白...
非变性质谱可以以前所未有的速度和灵敏度探测蛋白质-小分子相互作用,为药物发现过程中经常遇到的多分散生物分子系统提供独特的见解。在这篇综述中,我们描述了非变性质谱在研究小分子药物和蛋白质(包括大型多蛋白复合物和膜蛋白)之间相互作用方面的潜在和已证实的应用。本文讨论了定量配体结合的热力学和动力学性质的方法...
小分子是指分子量相对较小的有机物,如药物、激素、氨基酸等,它们能够与蛋白质相互作用并影响其功能。理解蛋白质与小分子相互作用的分子机制对于药物设计、治疗疾病等方面都具有重要的意义。 一、蛋白质与小分子的相互作用类型 蛋白质与小分子之间存在多种相互作用,主要包括: 1.氢键。氢键是指一个分子中存在亚原子...
小分子可以与蛋白质相互作用,这种相互作用可以引起结构的改变,进而影响蛋白质的功能。小分子与蛋白质的相互作用主要有两种类型:1)亲和力/结合力,即两种分子间的相互吸引力;2)规则性的空间堆积,即分子之间的各种相互作用决定其中的相对排列方式。 具体来说,小分子与蛋白质的相互作用分为两种类型,一种是紧密结合,小分...