非变性质谱中的蛋白质-小分子相互作用 4. 结构分析的离子活化方法 4.1 碰撞诱导解离 4.2 表面诱导解离 4.3 电子解离技术(ExD) 4.4 紫外线光解离 参考文献 非变性质谱中的蛋白质-小分子相互作用 Protein−Small Molecule Interactions in Native Mass Spectrometry Jack L. Bennett, Giang T. H. Nguyen, William...
二、蛋白质与小分子的相互作用机制:神秘的“锁与钥匙” 1.配对的艺术:就像锁和钥匙 蛋白质和小分子互动的机制有点像“锁和钥匙”的关系。每个蛋白质的“结构”就像是一个锁,而小分子则是那把钥匙。钥匙得精准无误地插入锁芯,才能够开启锁的功能。这也是为什么蛋白质和小分子之间的结合需要极高的特异性——就...
1.静电作用(电荷-电荷相互作用): 这是由相反电荷之间的吸引(例如,阳离子和阴离子之间)或相同电荷之间的排斥引起的。 在蛋白质与带电小分子之间,这种作用通常非常显著,并能显著影响结合亲和力。 2.疏水作用(疏水相互作用): 当非极性分子或分子的非极性区域在水性环境中聚集时,会发生疏水作用。
——正如这篇综述所强调的,质谱方法和仪器的发展促进了蛋白质-配体相互作用的精确热力学、动力学和结构评价。这一切都可以通过几皮摩尔的蛋白质和几分钟的测量时间来实现,这使得在非变性质谱中研究蛋白质-小分子相互作用成为一种非常有效率且信息量很大的方法。在下一节中,我们将重点介绍上述方法学进展对药物开发工作...
小分子可以与蛋白质相互作用,这种相互作用可以引起结构的改变,进而影响蛋白质的功能。小分子与蛋白质的相互作用主要有两种类型:1)亲和力/结合力,即两种分子间的相互吸引力;2)规则性的空间堆积,即分子之间的各种相互作用决定其中的相对排列方式。 具体来说,小分子与蛋白质的相互作用分为两种类型,一种是紧密结合,小分...
小分子是指分子量相对较小的有机物,如药物、激素、氨基酸等,它们能够与蛋白质相互作用并影响其功能。理解蛋白质与小分子相互作用的分子机制对于药物设计、治疗疾病等方面都具有重要的意义。 一、蛋白质与小分子的相互作用类型 蛋白质与小分子之间存在多种相互作用,主要包括: 1.氢键。氢键是指一个分子中存在亚原子...
小分子则是生命体内重要的调节因子,它们能够通过与蛋白质的相互作用来调节蛋白质的结构和功能。本文将简要介绍蛋白质和小分子相互作用的几种基本形式,并重点讨论了目前研究中发现的一些重要调控机制。 一、蛋白质和小分子相互作用的基本形式 蛋白质和小分子之间的相互作用可以分为几种基本形式,其中最为常见的包括以下...
导读:蛋白质相互作用(PPIs)是许多生物过程的基础,在各种疾病的发生和发展中起着重要作用。靶向肿瘤相关蛋白与新兴小分子药物之间的相互作用已成为治疗人类疾病,尤其是肿瘤的一种有吸引力的方法。令人鼓舞的是,基于PPI的选择性治疗药物在过去十年中迅速发展,为癌症患者的新疗法提供了有希望的前景。
当蛋白质与小分子相互作用时,它们之间的相互作用可以是多种多样的。比如,小分子物质可以与蛋白质分子相互结合,使得蛋白质分子的原有构象发生改变,从而影响蛋白质的生物功能。此外,小分子物质也可以与蛋白质分子内的某个特定区域发生相互作用,从而影响蛋白质分子内的化学反应和功能。 二、研究方法 为了研究蛋白质与小分...
1.静电作用（电荷-电荷相互作用）：这是由相反电荷之间的吸引（例如，阳离子和阴离子之间）或相同电荷之间的排斥引起的。在蛋白质与带电小分子之间，这种作用通常非常显著，并能显著影响结合亲和力。2.疏水作用（疏水相互作用）：当非极性分子或分子的非极性区域在水性环境中聚集时，会发生疏水作用。这种...