小分子的产生和代谢是一系列调节事件的最终结果,蛋白质组学引起的功能改变会在代谢层面放大。 蛋白质组和代谢组的关联分析,主要分为以下两个方面: 1.基于通路层面的联合分析: 通过KEGG 代谢通路将蛋白质组和代谢组数据联合起来,找到同一生物进程(KEGG Pathway)中发生显著性变化的蛋白质和代谢物,快速锁定关键蛋白和代...
>>>对蛋白组和代谢组两个组学数据进行整合分析,快速筛选数据,找到共同参与某类代谢通路或者具有相同变化趋势的差异蛋白和差异代谢物,系统描述生物体内的分子调控机制,为后续试验验证与分析提供数据基础。 01 联合分析思路 1)基于通路层面的联合分析 通过KEGG 代谢通路将蛋白质组和代谢组数据联合起来,找到同一生物进程(KE...
01 基于通路层面的联合分析:通过整合KEGG代谢通路,将蛋白质组和代谢组数据结合起来,筛选在同一生物过程内发生显著变化的蛋白质和代谢物,从而迅速定位关键的分子。同时,可借助富集分析和KEGG通路的标色技术,实现数据关联的可视化呈现,便于结果的理解和展示。 02 基于表达层面的联合分析:通过对差异表达的蛋白和代谢物的表...
联合分析蛋白组学和代谢组学数据可以帮助我们发现新的生物标志物。生物标志物是指在特定生理或病理状态下,能够反映该状态的分子指标。通过比较健康组织和疾病组织中蛋白质和代谢物的差异,我们可以筛选出与疾病相关的标志物,并进一步验证其在临床上的应用价值。3.2 疾病机制的解析 联合分析蛋白组学和代谢组学数据可以...
中文标题:蛋白质组学和代谢组学联合分析为早花百子莲胚性能力的获得提供见解 研究对象:早花百子莲 发表期刊:Frontiers in Plant Science 影响因子:6.627 发表时间:2022年5月 合作单位:信阳农林学院园艺学院、塔里木大学植物科学学院 运用生物技术:转录组学、蛋白质组学、代谢组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)...
蛋白组和代谢组联合分析的意义在于可以综合考虑蛋白质和代谢产物的变化,从而更全面地理解生物体内的生物过程。蛋白质是生物体内的重要功能分子,参与了几乎所有的生物过程,而代谢产物则是生物体内代谢活动的结果。通过联合分析蛋白组和代谢组的数据,可以揭示蛋白质和代谢产物之间的相互作用和调控机制,进一步理解生物体内...
为深入理解DAP的作用机制,研究者运用蛋白质组学和代谢组学,识别出与神经病理性疼痛相关的生物标志物,并探索DAP如何影响这些生物标志物的表达。综合分析DAP在分子层面上对疼痛信号通路的调控作用。02 研究结果 研究结果表明,DAP显著改善了MWT和TWT,显著抑制了脊髓组织中炎症因子的表达,抑制了微胶质细胞的激活。基于...
1)通过蛋白组和代谢组在人海马组织中发现了性别特异的AD靶标; 2)在女性海马组织中,D-Ser/total Ser 比率显著增加,且胰岛素信号通路激活表达; 3)AD患者中D-Asp 和 L-Asp等蛋白变化与性别无显著关联关系。 联合分析策略小结 转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: ...
代谢组学:用于深入探究肝细胞在苯并芘(Bap)影响下的代谢变化。蛋白质组学:揭示Bap作用下肝细胞内潜在的靶蛋白。ROS检测:评估苯并芘对肝细胞内活性氧水平的影响。质粒转染:用于进一步研究特定基因在苯并芘作用下的表达变化。细胞活性检测:评估苯并芘对肝细胞活力的影响。图形摘要:相关实验数据的可视化呈现。研究结果 ...