小分子的产生和代谢是一系列调节事件的最终结果,蛋白质组学引起的功能改变会在代谢层面放大。 蛋白质组和代谢组的关联分析,主要分为以下两个方面: 1.基于通路层面的联合分析: 通过KEGG 代谢通路将蛋白质组和代谢组数据联合起来,找到同一生物进程(KEGG Pathway)中发生显著性变化的蛋白质和代谢物,快速锁定关键蛋白和代...
01 基于通路层面的联合分析:通过整合KEGG代谢通路,将蛋白质组和代谢组数据结合起来,筛选在同一生物过程内发生显著变化的蛋白质和代谢物,从而迅速定位关键的分子。同时,可借助富集分析和KEGG通路的标色技术,实现数据关联的可视化呈现,便于结果的理解和展示。 02 基于表达层面的联合分析:通过对差异表达的蛋白和代谢物的表...
联合分析蛋白组学和代谢组学数据可以帮助我们发现新的生物标志物。生物标志物是指在特定生理或病理状态下，能够反映该状态的分子指标。通过比较健康组织和疾病组织中蛋白质和代谢物的差异，我们可以筛选出与疾病相关的标志物，并进一步验证其在临床上的应用价值。3.2 疾病机制的解析 联合分析蛋白组学和代谢组学数据可以...
KEGG分析显示，这些DAPs主要参与萜类化合物和聚酮化合物的代谢、外源性生物降解和代谢、氨基酸代谢、聚糖生物合成和代谢、脂质代谢、其他氨基酸代谢、内分泌系统、辅因子和维生素代谢和碳水化合物代谢。在DAPs中，过氧化物酶（A0A5P1F2L4）、C2H2型结构域蛋白（A0A5P1FM85）和组蛋白H2B（A0A5P1FK74）在IOC和IEC中...
蛋白组和代谢组联合分析的意义在于可以综合考虑蛋白质和代谢产物的变化，从而更全面地理解生物体内的生物过程。蛋白质是生物体内的重要功能分子，参与了几乎所有的生物过程，而代谢产物则是生物体内代谢活动的结果。通过联合分析蛋白组和代谢组的数据，可以揭示蛋白质和代谢产物之间的相互作用和调控机制，进一步理解生物体内...
转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; ...
代谢组学：用于深入探究肝细胞在苯并芘（Bap）影响下的代谢变化。蛋白质组学：揭示Bap作用下肝细胞内潜在的靶蛋白。ROS检测：评估苯并芘对肝细胞内活性氧水平的影响。质粒转染：用于进一步研究特定基因在苯并芘作用下的表达变化。细胞活性检测：评估苯并芘对肝细胞活力的影响。图形摘要：相关实验数据的可视化呈现。研究结果 ...
为深入理解DAP的作用机制，研究者运用蛋白质组学和代谢组学，识别出与神经病理性疼痛相关的生物标志物，并探索DAP如何影响这些生物标志物的表达。综合分析DAP在分子层面上对疼痛信号通路的调控作用。02 研究结果 研究结果表明，DAP显著改善了MWT和TWT，显著抑制了脊髓组织中炎症因子的表达，抑制了微胶质细胞的激活。基于...
近日,首都医科大学附属北京朝阳医院王广教授团队在Diabetology & Metabolic Syndrome杂志(IF=4.8)发表最新研究成果,通过蛋白质组学和代谢组学的联合分析,初次研究了SGLT2i达格列净对T2D患者血清蛋白质和代谢物的影响,为探索达格列净在心肾...