PTMs对蛋白质功能影响具有多样性,主要表现在以下三个方面:(1)同一蛋白质,即使只发生一种类型的修饰,也可能会赋予多种功能;(2)同一蛋白的同一种翻译后修饰,如果发生在不同氨基酸上,其功能也可能不同;(3)同一蛋白还可能具有不同的修饰,其功能和参与的生物过程就更为复杂。 SUMO化修饰过程 小泛素相关修饰物(smal...
蛋白质裂解:是指将蛋白质分子切割成更小的片段,常见的裂解方式包括胰蛋白酶、丝氨酸蛋白酶和精氨酸蛋白酶等。 其他修饰:还有其他许多种蛋白质修饰方式,例如硝化、脂化和磺酰化等。 蛋白质乙酰化:是将乙酰基团添加到蛋白质分子中的赖氨酸残基上的过程,可以影响蛋白质的功能、稳定性和亲水性等。 蛋白质泛素化:是...
蛋白质的修饰有多种类型,除了常见的无机和有机小分子修饰,还有一类用小肽进行修饰的,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。
肝脏糖脂代谢失调是2型糖尿病、非酒精性脂肪肝等代谢性疾病发病的重要因素,因此作者通过高脂高糖饮食或胰岛素刺激条件对大鼠肝脏中进行泛素修饰蛋白组,最终鉴定了1267个泛素化蛋白,通过对这些蛋白进行pathway分析,发现主要富集在TCA循环、糖酵解/糖异生、脂肪酸代谢、碳代谢等途径,表明大鼠肝脏泛素对饮食或胰岛素刺激敏感...
蛋白质的翻译后修饰参与许多生物过程,在蛋白修饰的领域中,存在着非常非常多的类型。 图2.蛋白修饰类型丰富 磷酸化 蛋白质的磷酸化是通过酶促反应将磷酸基团转移到蛋白组氨基酸残基上的过程,在生物体内普遍存在,蛋白质的磷酸化与去磷酸化这一可逆过程几乎参与了生命活动的所有过程,与信号传导、细胞周期、生长发育、癌症...
在先前的推文“解析表观遗传学的工具——ChIP-seq(一)”中小远详细的描述过核小体的结构和组蛋白修饰,在这里带大家再回顾一下。简单来说,核小体由H2B、H2A、H3、H4四种组蛋白(Histone)亚基各两个拷贝形成的八聚体和缠绕在外约146bp的DNA组成(图1)。其中组蛋白N端(尾部)的氨基酸残基易受到翻译后修饰(PTM),...
图1蛋白质发生SUMO化修饰的生化过程[1] 首先,SUMO的几个C-末端氨基酸被SUMO特异性蛋白酶(sentrin/SUMO-specific proteases, SENP)所降解,暴露出二甘氨酸残基并成为成熟的SUMO。接着,在ATP的调节作用下,SUMO的二甘氨酸残基与E1激活酶的半胱氨酸残基结合形成活化的SUMO...
组蛋白磷酸化 磷酸化是最常见的蛋白质翻译后修饰之一，通常发生在丝氨酸（Ser）、苏氨酸（Thr）和酪氨酸（Tyr）残基上，由磷酸化酶或激酶调控的一个可逆性修饰，即酶将ATP上的磷酸基团转移到受体氨基酸残基上或从受体残基上去除。此外，精氨酸和组氨酸也存在磷酸化修饰，但由于它们的不稳定性，因此生物化学性质还不...
组蛋白修饰与多种细胞过程有关，包括DNA复制、转录和染色质浓缩等等。例如组蛋白修饰可以改变其物理特征来改变核小体间的联系，如组蛋白乙酰化被认为使能够中和高碱性组蛋白尾巴的正电荷，使染色质发生局部扩张，从而使转录调控因子更容易结合到DNA上。4、组蛋白修饰的命名规则：开头表示组蛋白的名称，紧接着是被修饰...
前面我们了解了染色质的基本组成结构单位是核小体,因此参与核小体装配的组蛋白是决定染色质包装程度的重要因素之一。 一、组蛋白修饰简介 人类一个细胞内的DNA长度约为2米,如果把人体细胞内的DNA全部展开,其长度约是太阳系直径的2倍。经过高度折叠压缩后才变成纳米至微米级染色体/质的结构,...