当然是有的,现在这里有一批少人知道的、空白的473种肠道菌群数据: 这批数据的最佳抢发时机就是现在,因为比较少人知道,也不容易整理: 肠道菌群孟德尔随机化行情分析: 211种肠道菌群(已经完全烂大街) 412种肠道菌群(很多人已经投稿了) 473种肠道菌群(基本都是空白的) 这473数据下载是非常容易的,就在GWAS catalog上...
生信分析:掌握数据分析的关键❗🔥❗ #医学生 #肠道菌群 #, 视频播放量 96、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 花哩阿, 作者简介 提供生信 生物信息数据分析服务,相关视频:473种肠道菌群联合免疫细胞高级孟德尔随机化思路,超好
肠道菌群结构的紊乱会诱发肠道疾病[3]。甚至一些看似与肠道系统关联不大的疾病(如肥胖、糖尿病、克罗恩病等)也与肠道微生物有着密切的联系[4,5]。这些紧密的联系,往往需要我们通过不同的分析手段去深入挖掘。 (一) 与环境因子等相关的肠道微生态研究 通常我们通过研究肠道微生物的群落结构来揭示其与疾病、免疫等...
03-04.中国500肠道肠道菌群暴露数据准备 - 文云博士于20240913发布在抖音,已经收获了8137个喜欢,来抖音,记录美好生活!
不过这种基于人类测序数据的总是有一个偏差,因此文章前面绝大部分是去除这些偏移。经过详细的操作之后,就获得了TCGA肠道菌群的数据了(The Cancer Microbiome Atlas, TCMA)。 聚类分析 在经过一系列的算法的操作之后,作者获得了肠道各个样本的微生物菌群。因此也就对这些数据进行了简单的分析。首先作者使用SparCC算法来对...
聚类分析 在经过一系列的算法的操作之后,作者获得了肠道各个样本的微生物菌群。因此也就对这些数据进行了简单的分析。首先作者使用SparCC算法来对肠道肿瘤CRC(COAD/READ)进行了聚类分析。最后发现CRC总共可以分成梭菌和拟杆菌两个聚类种群。 进一步基于两个聚类的分型,来分析不同的菌群对于其他组学RNA-seq、miRNA-seq、...
肠道菌群分析R语言 代谢组学分析数据分析与制图方法 一、实验简介 DNA测序菌种鉴定实验是一种基于DNA测序技术进行的微生物鉴定方法。该方法通常基于16S rRNA基因序列进行分析,该基因是细菌和古菌共有的序列,但在不同的菌株中存在变异。通过对菌株的16S rRNA基因进行PCR扩增和测序,可以确定菌株的身份,并与已知的细菌或...
关机睡一觉批量肠道菌群孟德尔随机化分析就完事了～#科研狗的日常 #数据分析 #孟德尔随机化分析 - 医小研于20240524发布在抖音,已经收获了7403个喜欢,来抖音,记录美好生活!
传统的肠道菌群孟德尔随机化用的数据都是来源于这一个数据库:MiBioGen,传统的分析内容都是:211种肠道菌群与结局的批量孟德尔随机化分析(一正);结局与211种肠道菌群的批量孟德尔随机化分析(一反)。 像这种用传统数据、传统分析套路的文章已经在发表了200多篇文章,现在早已经烂大街了,很多想到的课题都被别人发表了文章...
这篇文章主要就是通过TCGA当中消化道肿瘤方面中的全基因组测序(whole genome sequence, WGS)以及全外显子测序(whole exon sequence, WXS)的数据利用Pathseq的算法来评估微生物菌群。不过这种基于人类测序数据的总是有一个偏差,因此文章前面绝大部分是去除这些偏移。经过详细的操作之后,就获得了TCGA肠道菌群的数据了(The...