翻译组+转录组——明确定位 组学搭配更出效果 翻译组(Ribo-seq)加上精准定量的转录组(UMI转录组),不仅可以揭示 mRNA 翻译效率,还可以在翻译层面解释翻译组与蛋白组数据的衔接机制,如翻译效率下降而转录本水平不变导致的蛋白水平的变化。 诺禾致源关联分析...
“flavonoid biosynthesis”)内的基因进行三组学的相关性分析,可发现转录组-翻译组的相关性较高(R2=0.6930,0.8782,0.9359),而转录组-蛋白质、翻译组-蛋白质组的相关性趋于一致,暗示相比于转录后调控,翻译后调节对这些基因的影响更高。
翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA、circRNA等)的信息与精确定量。 Ribo-seq (Ribosome profiling sequencing)是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被核糖体保护的正在翻译的RNA片段(ribos...
Ribo-seq(核糖体印记测序),作为一种翻译组测序技术,已被广泛应用于研究细胞内mRNA的翻译动态。通过测序与核糖体结合的mRNA片段(RPFs),该技术能够揭示在特定条件下哪些mRNA正在被翻译,以及它们的翻译效率和起始位点等关键信息。Ribo-seq的应用极大地促进了对基因表达转录后调控、疾病机制和药物作用机理的理解。 二、Ribo...
表1. 多种翻译组技术对比 技术应用(联合longRNA-seq) 1. 确定蛋白翻译效率 2. 研究翻译调控和基因表达情况,如目标mRNA降解、翻译抑制3. 探究表观修饰的调控机制 4. 鉴定新生肽的共翻译降解5. 研究翻译事件,如核糖体合成、组装、翻译相关因子 技术优势 1. 蔗糖密度梯度离心分离多聚核糖体,翻译效率“黄金...
从下图可以看出,在中心法则中,翻译组处于转录组和蛋白组之间,因此上游与转录组关联,下游与蛋白组关联,可以研究基因表达过程中的翻译调控。这也是目前最多文章的做法。 一 翻译组与转录组的关联分析 绝大部分的翻译组文章都不会仅仅做翻译组,都起码会同时做相同样本的转录组RNA-seq,来进行关联分析。
YLMB翻译组 2023-9-4 09:58 来自荣耀50 Pro 5G 【抓马翻译 No.202】 斉藤壮馬超话#江口拓也# 《宵々モノローグ 》 忘记发了,先给组长滑跪本作和No.159的《黄昏アウトフォーカス》是一个系列,两位老司机虽然只在最后开了车,但中间的恋爱过程也很甜很顺很少女传送门见评论。 ...
广义的翻译组(Translatome)测序包括两大类:多聚核糖体测序(polyribosomeprofiling)和核糖体足迹测序(Ribosome footprints profiling)。虽然可以统称为翻译组,但这两类测序方法本质是实验方法的不同,对应的两种方法所得到的数据的功能也不同。 在讲翻译组的方法前,我们先要了解蔗糖密度梯度离心法。该方法的基本原理是:...
Ribo-seq可以研究细胞内基因翻译的水平、区域、速率等,结合转录组、小RNA测序、蛋白组等进行关联分析,可以更精确地研究转录后调控、翻译调控机制 实验流程 样本类型 1.细胞:数量≥1x107 2.组织:质量≥150mg 细胞样本需要用Cycloheximide (吉凯基因提供)进行预处理,再液氮速冻寄送; 组织样本也需要用含Cycloheximide的PB...
Ribosome profiling sequencing(简称Ribo-seq),又称为核糖体印记测序或翻译组测序,是一种可以精确定量样本中所有可翻译分子(包括经典的mRNA和其他潜在可以翻译RNA分子)瞬间翻译量的技术。 技术原理 图1 Ribo-seq 与RNA-seq的比较 相比传统的转录组测序(RNA-seq),Ribo-seq的关键特点是:只针对与核糖体结合,长度约为...