翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA、circRNA等)的信息与精确定量。 Ribo-seq (Ribosome profiling sequencing)是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被核糖体保护的正在翻译的RNA片段(ribos...
翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA, circRNA等)的信息与精确定量,是连接转录组与蛋白质组之间的桥梁。Ribo-seq (Ribosome profiling sequencing)是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被...
翻译组测序(Ribo-seq)是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA, circRNA等)的信息与精确定量,是连接转录组与蛋白质组之间的桥梁。 Ribo-seq是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被核糖体保护的正在翻...
Ribo-seq(核糖体印记测序),作为一种翻译组测序技术,已被广泛应用于研究细胞内mRNA的翻译动态。通过测序与核糖体结合的mRNA片段(RPFs),该技术能够揭示在特定条件下哪些mRNA正在被翻译,以及它们的翻译效率和起始位点等关键信息。Ribo-seq的应用极大地促进了对基因表达转录后调控、疾病机制和药物作用机理的理解。 二、Ribo...
Ribo-seq(核糖体印记测序),作为一种翻译组测序技术,已被广泛应用于研究细胞内mRNA的翻译动态。通过测序与核糖体结合的mRNA片段(RPFs),该技术能够揭示在特定条件下哪些mRNA正在被翻译,以及它们的翻译效率和起始位点等关键信息。Ribo-seq的应用极大地促进了对基因表达转录后调控、疾病机制和药物作用机理的理解。 Ribo-seq...
Ribo-seq可以研究细胞内基因翻译的水平、区域、速率等,结合转录组、小RNA测序、蛋白组等进行关联分析,可以更精确地研究转录后调控、翻译调控机制 实验流程 样本类型 1.细胞:数量≥1x107 2.组织:质量≥150mg 细胞样本需要用Cycloheximide (吉凯基因提供)进行预处理,再液氮速冻寄送; 组织样本也需要用含Cycloheximide的PB...
翻译组测序(Ribo-seq)是一种通过测序技术来研究细胞内基因翻译水平、区域和速率的方法。它通过利用RNA酶消化细胞中的RNA,获取被核糖体保护的正在翻译的RNA片段(ribosome footprints, RFs),然后对这些片段进行深度测序和分析。Ribo-seq技术是连接转录组与蛋白质组之间的桥梁,可以精确获取样本中所有可翻译分子的信息。📖...
Ribosome profiling sequencing(简称Ribo-seq),又称为核糖体印记测序或翻译组测序,是一种可以精确定量样本中所有可翻译分子(包括经典的mRNA和其他潜在可以翻译RNA分子)瞬间翻译量的技术。 技术原理 图1 Ribo-seq 与RNA-seq的比较 相比传统的转录组测序(RNA-seq),Ribo-seq的关键特点是:只针对与核糖体结合,长度约为...
核糖体是将mRNA编码序列解码为蛋白序列的核心机器,ribosome profiling(又称Ribo-seq、核糖体测序等)通过捕获翻译过程中核糖体保护的RNA片段,并对这些片段进行测序,可在组学层面检测细胞内瞬时蛋白表达情况。自2009年首次应用于酵母翻译组研究以来,Ribo-seq已在大量研究中被广泛使用。然而如何获得高质量的Ribo-seq数据在...
核糖体印迹测序(Ribosome profiling,Ribo-seq),能够详细检测体内的翻译状态。Ribo-seq的技术核心是识别与核糖体结合的mRNA以及正在被翻译的约30个核苷酸。对核糖体结合的mRNA片段进行测序,能够精确记录核糖体在翻译过程中的位置。将转录组与Ribo-seq数据联合分析,可以计算出蛋白质的合成速率。