网络药理学通过整合多成分、多靶点相互作用,揭示中药复方整体协同作用机制。 网络药理学的发展为研究中药复方提供了系统化的方法框架。其核心逻辑为:1)运用数据库挖掘与分子对接技术分析复方活性成分;2)构建"成分-靶点-通路"多层次网络模型,识别关键调控靶点和信号通路;3)通过动物实验/细胞实验验证网络预测结果。该方法突破传...
中药处方四逆汤(SND)对脓毒症患者具有缓解炎症、改善微循环、调节免疫状态的作用。然而,其潜在机制尚不清楚。本研究通过网络药理学分析,探讨SND治疗脓毒症的作用机制。 首先通过WGCNA分析发现CX3CR1是影响脓毒症预后的关键基因。利用中药系统药理学(TCMSP)数据库和Cytoscape软件构建SND药物活性成分-靶点网络。通过GEO数...
网络药理学(network pharmacology)是由Hopkins首先提出的方法,它集合了高通量数据整合、数据库检索、数据挖掘、靶点预测、以及模拟实验室等多种研究手段,从系统的角度展现中药成分靶点间的相互联系和作用,网络药理学能够整体地分析中药复方“多成分”的作用机制,也能独立呈现某种特定疾病相关的“活性成分-靶点-通路”,其系...
1.2 网络药理学 1.2.1 核心药物潜在靶点获取 结合中药使用频次、关联规则分析结果,筛选出中药复方专利核心药物,借助中药系统药理数据库与分析平台 (TCMSP, http: //tcmspw.com/tcmsp.php) 获得核心药物所含活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%、类...
在中药复方的网络药理学分析中,第一步就是获取复方中药活性小分子及其对应靶点,常规做法是在TCMSP搜索相关中药,再根据(OB>30,DL>0.18)筛选出符合条件的小分子,再获取对应的小分子靶点。这里记录下使用网络爬虫的方法一步获取这些信息。 如某中药复方包含以下中药成份,首先需要在TCMSP中确定可以检索到对应的成份,记录其...
综上,本研究通过数据挖掘方法,分析治疗胃癌的中药复方专利的性味归经、高频用药和用药配伍规律,反映出中药复方专利治疗胃癌有一定规律可循。并利用网络药理学手段分析了白花蛇舌草、黄芪、半枝莲治疗胃癌的多成分,多靶点,多通路的作用机制。期...
今天就推荐这篇发表在Phytomedicine的题为“Effect and mechanism of Banxia Xiexin decoction in colorectal cancer: A network pharmacology approach”网络药理学分析和实验验证探讨半夏泻心汤治疗结直肠癌机制的文章。 1. 网络药理学方法的应用:本研究创新性地采用网络药理学方法,系统地探究了半夏泻心汤(BXD)的复杂...
中药复方的网络药理学研究方法主要分为三个步骤:建立中药复方化学成分的数据库;构建药物-靶标-疾病网络;分析网络中的核心节点和关键通路。建立中药复方化学成分的数据库是进行网络药理学研究的基础。目前已有多个中药化学成分数据库,像TCMSP、TCMID、STITCH等。这些数据库收录了大量中药复方的化学成分信息,可供后续研究...
复方网络的构建:网络文件就是2列,没有多余的,2列包含了药物-成分,成分-靶点。type文件至少2列,一列是节点,一列是自定义节点的属性。2列就够基本作图了。还可以增加别的列,比如权重,这样可以根据权重调节节点大小。 (1)找到各个中药间的重复成分 (2)准备好网络及属性文件(多核对几次,避免错漏,对于重复成分要...
网络药理学强调从整体和系统的角度研究药物与生物系统的相互作用,通过构建复杂的生物网络,深入揭示药物作用的多成分、多靶点、多途径协同作用机制。中药复方作为中医药学的重要组成部分,其独特的疗效和复杂的作用机制一直是研究的热点和难点。传统的中药研究方法往往侧重于单一成分或单一靶点的分析,难以全面揭示中药复方的整...