从本期开始,我们开始介绍TCGA (The Cancer Genome Atlas, 肿瘤基因组图谱) 数据库。TCGA是里程碑式的癌症基因组项目。相信很多人都听过或使用过TCGA数据库,网上也有非常多的关于TCGA介绍,利用该数据库的研究也不计其数。该数据库面向科学界和一般群众开放。 TCGA数据库是由美国National Cancer Institute ( NCI, 美...
而事实上,这些文章都是TCGA的收官项目之作-泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas)的部分文章,泛癌症图谱总共包括27篇文章,一共可以分成3个部分,每个部分由一篇重磅Cell文章领头,其他的文章已经发表于CellPress旗下的其他著名期刊,比如Cancer Cell等杂志。 癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)想必早已为全世界广为...
癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA) 早已为全世界广为知晓,这项计划于2005年提出,旨在通过基因组学分析技术,将人类全部癌症的基因组变异图谱绘制出来,从而更好地了解癌症发生和发展的机制。尽管如今TCGA项目已经囊括了33种最常见癌症且超过11000个肿瘤样本的测序等工作,然而,它还没有完全结束。 02TCGA Ba...
胶质母细胞瘤多组学数据六基因组合预后模型癌症基因组图谱计划胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)是最常见的原发性颅内肿瘤,恶性程度极高,患者预后极差.为了识别GBM预后生物标记物,建立预后模型,本研究通过分析癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中GBM的表达谱数据,筛选出不同生存期GBM患者差异基因.利...
项目对属于38种不同肿瘤类型的2600多个基因组进行分析，创建了巨大的原发癌基因组资源库。多个研究团队...
4月5日,国际顶级学术期刊《Cell》在最新一期中,采用封面形式,发表了包括评论和社论在内的超过8篇文章聚焦了人类的一项伟大成就:人类癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)。 ▲最新一期著名学术期刊《Cell》以封面形式聚焦泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas) 今天必然是整个生物医学领域欢呼的一天! 美国国立卫生研...
癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)是国际癌症基因组联盟最大的一个研究项目。该项目启动于2006年,耗资1亿美元,目的在于绘制1万个肿瘤基因组图谱。 如今来自16个国家的科学家已经通过通力合作完成了该项目,揭示了近10000个与癌症相关的基因突变。那么下一步科学家们该去做什么?一些科学家希望继续关注...
TCGA的意义在于提供数据基础：1. 易感基因的发现，提示肿瘤高发可能性，防癌胜于治癌 ；2.靶点基因的...
癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)在2006年首先作为试点项目开展,任务是产生所有类型肿瘤变化的综合全景图,旨在对癌症生物学获得新的见解,可能用来开发更好的治疗方法。 在数据生成方面,该项目已经取得无可争议的成功。自其成立的近十年以来,总投资共有3.75亿美元,TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的...
2013年,癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)公布了子宫内膜癌新分型系统——TCGA分型,彻底颠覆了子宫内膜癌传统风险分层和预后模式[1]。此后,来自加拿大英属哥伦比亚大学和荷兰莱登大学的研究者分别提出了ProMisE分型和TransPORTEC...