以下是沉默基因簇的一些主要特点: 1. 低表达或不表达:沉默基因簇最显著的特点是它们在细胞中的转录水平非常低或几乎不被检测到。这可能是由于缺乏必要的转录因子结合位点,或者是因为表观遗传修饰导致基因的沉默。 2. 表观遗传调控:沉默基因簇常常受到DNA甲基化和组蛋白修饰等表观遗传机制的影响。这些化学修饰可以...
根据次生代谢产物激活的可预测性和不可预测性,我们将目前的激活策略分为非定向的沉默基因簇激活策略和定向的沉默基因簇激活策略(见图 1):非定向激活策略包括基于培养基成分改变或培养条件优化的激活策略、基于微生物共培养的激活策略、基于表观...
微生物基因组测序为科学家揭示了大量未经鉴定的天然产物合成基因簇。 这些基因簇编码的代谢产物数量繁多,但在常规的生长条件下绝大多数基因是暂时丧失表达活性的沉默基因,部分基因即使能够表达其表达水平也很低,如何激活提高这些基因簇的表达水平成为当下亟需解决的难题。 核糖体不仅是蛋白质的合成机器, 也是细胞感知营...
通过分子遗传操纵调控因子来激活真菌沉默基因簇是课题组研究方向之一。近年来,研究组已成功将该技术应用到多株真菌的沉默基因簇激活,并获得新颖化合物近50个。例如, ——通过敲除植物内生菌无花果拟盘多毛孢(Pestalotiopsis fici)中表观遗传因子CclA、HdaA激活了一系列聚酮类化合物,发现新化合物15个(Organic Letters...
通过分子遗传操纵调控因子来激活真菌沉默基因簇是课题组研究方向之一。近年来,研究组已成功将该技术应用到多株真菌的沉默基因簇激活,并获得新颖化合物近50个。例如: ——通过敲除植物内生菌无花果拟盘多毛孢(Pestalotiopsis fici)中表观遗传因子CclA、HdaA激活了一系列聚酮类化合物,发现新化合物15个(Organic Letters,...
沉默基因簇的问题具有挑战性,因为未知信号会激活未表征的基因簇,从而导致新代谢物的产生在这个过程中有三个变量,其中两个变量可以通过实验或计算确定:生物信息学方法可以方便地鉴定产生非核糖体肽、聚酮和萜烯类的基因,并且很好地保真地确定这些家族中的新代谢物的基因组合。该基因簇一旦被激活,就可以通过差异代谢组学...
在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学和新加坡科技研究局的研究人员利用CRISPR-Cas9技术激活链霉菌中不表达的或者说沉默的基因簇。相关研究结果于2017年4月10日在线发表在Nature Chemical Biology期刊上,论文标题为“CRISPR–Cas9 strategy for activation of silent Streptomyces biosynthetic gene clusters”。论文通信作者...
沉默基因簇是指在常规培养条件下未表达 或表达量很低的基因簇。随着DNA 测序技术的突飞猛进，越来越多的微生物全基因组被测出来，利用生物信息学分析这些基因组数据，发现了基因组中存在许多的沉默基因簇。微生物中存在的沉默基因簇远比它目前已报道发现的次级代谢产物要多得多，如根据报道目前天蓝色链霉菌中发现的...
沉默基因簇挖掘与微生物菌株育种 菌种选育杂交育种 01:11:29
激活微生物沉默基因簇合成新型天然产物的研究 赵琪,闵涛玲,胡海峰* (中国医药工业研究总院上海医药工业研究院创新药物与制药工艺国家重点实验室,上海200437) 摘要:随着微生物基因组测序项目开展,越来越多的沉默基因簇被发现。采用激活微生物沉默基因簇的方法,可以充分发掘 ...